Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRJ1

C8orf17, Protein MOST-1, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf17Q9NRJ1 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC10.76□□□□□ -0.69
C8orf17Q9NRJ1 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
C8orf17Q9NRJ1 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
C8orf17Q9NRJ1 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
C8orf17Q9NRJ1 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
C8orf17Q9NRJ1 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
C8orf17Q9NRJ1 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
C8orf17Q9NRJ1 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
C8orf17Q9NRJ1 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
C8orf17Q9NRJ1 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
C8orf17Q9NRJ1 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
C8orf17Q9NRJ1 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
C8orf17Q9NRJ1 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
C8orf17Q9NRJ1 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
C8orf17Q9NRJ1 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
C8orf17Q9NRJ1 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
C8orf17Q9NRJ1 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
C8orf17Q9NRJ1 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
C8orf17Q9NRJ1 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
C8orf17Q9NRJ1 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
C8orf17Q9NRJ1 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
C8orf17Q9NRJ1 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
C8orf17Q9NRJ1 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
C8orf17Q9NRJ1 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
C8orf17Q9NRJ1 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
C8orf17Q9NRJ1 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
C8orf17Q9NRJ1 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
C8orf17Q9NRJ1 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
C8orf17Q9NRJ1 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
C8orf17Q9NRJ1 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
C8orf17Q9NRJ1 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
C8orf17Q9NRJ1 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
C8orf17Q9NRJ1 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
C8orf17Q9NRJ1 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
C8orf17Q9NRJ1 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
C8orf17Q9NRJ1 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
C8orf17Q9NRJ1 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
C8orf17Q9NRJ1 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
C8orf17Q9NRJ1 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
C8orf17Q9NRJ1 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
C8orf17Q9NRJ1 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
C8orf17Q9NRJ1 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
C8orf17Q9NRJ1 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
C8orf17Q9NRJ1 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
C8orf17Q9NRJ1 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
C8orf17Q9NRJ1 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
C8orf17Q9NRJ1 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
C8orf17Q9NRJ1 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
C8orf17Q9NRJ1 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
C8orf17Q9NRJ1 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
C8orf17Q9NRJ1 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
C8orf17Q9NRJ1 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
C8orf17Q9NRJ1 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
C8orf17Q9NRJ1 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
C8orf17Q9NRJ1 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
C8orf17Q9NRJ1 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
C8orf17Q9NRJ1 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
C8orf17Q9NRJ1 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
C8orf17Q9NRJ1 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
C8orf17Q9NRJ1 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
C8orf17Q9NRJ1 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
C8orf17Q9NRJ1 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
C8orf17Q9NRJ1 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
C8orf17Q9NRJ1 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
C8orf17Q9NRJ1 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
C8orf17Q9NRJ1 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
C8orf17Q9NRJ1 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
C8orf17Q9NRJ1 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
C8orf17Q9NRJ1 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
C8orf17Q9NRJ1 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
C8orf17Q9NRJ1 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
C8orf17Q9NRJ1 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
C8orf17Q9NRJ1 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
C8orf17Q9NRJ1 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
C8orf17Q9NRJ1 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
C8orf17Q9NRJ1 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
C8orf17Q9NRJ1 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
C8orf17Q9NRJ1 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
C8orf17Q9NRJ1 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
C8orf17Q9NRJ1 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
C8orf17Q9NRJ1 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
C8orf17Q9NRJ1 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
C8orf17Q9NRJ1 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC10.75□□□□□ -0.69
C8orf17Q9NRJ1 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
C8orf17Q9NRJ1 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
C8orf17Q9NRJ1 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
C8orf17Q9NRJ1 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
C8orf17Q9NRJ1 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
C8orf17Q9NRJ1 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
C8orf17Q9NRJ1 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
C8orf17Q9NRJ1 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
C8orf17Q9NRJ1 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
C8orf17Q9NRJ1 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
C8orf17Q9NRJ1 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
C8orf17Q9NRJ1 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
C8orf17Q9NRJ1 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
C8orf17Q9NRJ1 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
C8orf17Q9NRJ1 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
C8orf17Q9NRJ1 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
C8orf17Q9NRJ1 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms