Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRF2

SH2B1, SH2B adapter protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH2B1Q9NRF2 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SH2B1Q9NRF2 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SH2B1Q9NRF2 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SH2B1Q9NRF2 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SH2B1Q9NRF2 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SH2B1Q9NRF2 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SH2B1Q9NRF2 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SH2B1Q9NRF2 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SH2B1Q9NRF2 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SH2B1Q9NRF2 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SH2B1Q9NRF2 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SH2B1Q9NRF2 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SH2B1Q9NRF2 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SH2B1Q9NRF2 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SH2B1Q9NRF2 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SH2B1Q9NRF2 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SH2B1Q9NRF2 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SH2B1Q9NRF2 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SH2B1Q9NRF2 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SH2B1Q9NRF2 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SH2B1Q9NRF2 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SH2B1Q9NRF2 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SH2B1Q9NRF2 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SH2B1Q9NRF2 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SH2B1Q9NRF2 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SH2B1Q9NRF2 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SH2B1Q9NRF2 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SH2B1Q9NRF2 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SH2B1Q9NRF2 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SH2B1Q9NRF2 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SH2B1Q9NRF2 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SH2B1Q9NRF2 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SH2B1Q9NRF2 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SH2B1Q9NRF2 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SH2B1Q9NRF2 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SH2B1Q9NRF2 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SH2B1Q9NRF2 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SH2B1Q9NRF2 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SH2B1Q9NRF2 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SH2B1Q9NRF2 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SH2B1Q9NRF2 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SH2B1Q9NRF2 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SH2B1Q9NRF2 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SH2B1Q9NRF2 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SH2B1Q9NRF2 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SH2B1Q9NRF2 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SH2B1Q9NRF2 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SH2B1Q9NRF2 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SH2B1Q9NRF2 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SH2B1Q9NRF2 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SH2B1Q9NRF2 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SH2B1Q9NRF2 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SH2B1Q9NRF2 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SH2B1Q9NRF2 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SH2B1Q9NRF2 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SH2B1Q9NRF2 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SH2B1Q9NRF2 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SH2B1Q9NRF2 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SH2B1Q9NRF2 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SH2B1Q9NRF2 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SH2B1Q9NRF2 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SH2B1Q9NRF2 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SH2B1Q9NRF2 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SH2B1Q9NRF2 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SH2B1Q9NRF2 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SH2B1Q9NRF2 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SH2B1Q9NRF2 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SH2B1Q9NRF2 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SH2B1Q9NRF2 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SH2B1Q9NRF2 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SH2B1Q9NRF2 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SH2B1Q9NRF2 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SH2B1Q9NRF2 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SH2B1Q9NRF2 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SH2B1Q9NRF2 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SH2B1Q9NRF2 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SH2B1Q9NRF2 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SH2B1Q9NRF2 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SH2B1Q9NRF2 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SH2B1Q9NRF2 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SH2B1Q9NRF2 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SH2B1Q9NRF2 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SH2B1Q9NRF2 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SH2B1Q9NRF2 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SH2B1Q9NRF2 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SH2B1Q9NRF2 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SH2B1Q9NRF2 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SH2B1Q9NRF2 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SH2B1Q9NRF2 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SH2B1Q9NRF2 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SH2B1Q9NRF2 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SH2B1Q9NRF2 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SH2B1Q9NRF2 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SH2B1Q9NRF2 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SH2B1Q9NRF2 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SH2B1Q9NRF2 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SH2B1Q9NRF2 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SH2B1Q9NRF2 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SH2B1Q9NRF2 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SH2B1Q9NRF2 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms