Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LHX9Q9NQ69 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LHX9Q9NQ69 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LHX9Q9NQ69 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LHX9Q9NQ69 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LHX9Q9NQ69 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LHX9Q9NQ69 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LHX9Q9NQ69 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LHX9Q9NQ69 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LHX9Q9NQ69 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LHX9Q9NQ69 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LHX9Q9NQ69 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LHX9Q9NQ69 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LHX9Q9NQ69 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LHX9Q9NQ69 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LHX9Q9NQ69 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LHX9Q9NQ69 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LHX9Q9NQ69 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LHX9Q9NQ69 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LHX9Q9NQ69 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LHX9Q9NQ69 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LHX9Q9NQ69 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LHX9Q9NQ69 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LHX9Q9NQ69 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LHX9Q9NQ69 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LHX9Q9NQ69 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LHX9Q9NQ69 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LHX9Q9NQ69 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LHX9Q9NQ69 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LHX9Q9NQ69 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LHX9Q9NQ69 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LHX9Q9NQ69 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LHX9Q9NQ69 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LHX9Q9NQ69 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LHX9Q9NQ69 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LHX9Q9NQ69 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LHX9Q9NQ69 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
LHX9Q9NQ69 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LHX9Q9NQ69 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LHX9Q9NQ69 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LHX9Q9NQ69 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LHX9Q9NQ69 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LHX9Q9NQ69 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LHX9Q9NQ69 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LHX9Q9NQ69 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LHX9Q9NQ69 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LHX9Q9NQ69 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LHX9Q9NQ69 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LHX9Q9NQ69 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LHX9Q9NQ69 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LHX9Q9NQ69 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LHX9Q9NQ69 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LHX9Q9NQ69 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LHX9Q9NQ69 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
LHX9Q9NQ69 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LHX9Q9NQ69 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LHX9Q9NQ69 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
LHX9Q9NQ69 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LHX9Q9NQ69 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
LHX9Q9NQ69 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LHX9Q9NQ69 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
LHX9Q9NQ69 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LHX9Q9NQ69 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
LHX9Q9NQ69 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LHX9Q9NQ69 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LHX9Q9NQ69 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LHX9Q9NQ69 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
LHX9Q9NQ69 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
LHX9Q9NQ69 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LHX9Q9NQ69 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LHX9Q9NQ69 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LHX9Q9NQ69 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LHX9Q9NQ69 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LHX9Q9NQ69 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LHX9Q9NQ69 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LHX9Q9NQ69 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LHX9Q9NQ69 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LHX9Q9NQ69 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
LHX9Q9NQ69 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
LHX9Q9NQ69 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
LHX9Q9NQ69 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
LHX9Q9NQ69 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
LHX9Q9NQ69 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
LHX9Q9NQ69 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
LHX9Q9NQ69 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
LHX9Q9NQ69 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LHX9Q9NQ69 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LHX9Q9NQ69 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LHX9Q9NQ69 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LHX9Q9NQ69 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LHX9Q9NQ69 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LHX9Q9NQ69 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LHX9Q9NQ69 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LHX9Q9NQ69 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LHX9Q9NQ69 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LHX9Q9NQ69 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LHX9Q9NQ69 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LHX9Q9NQ69 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LHX9Q9NQ69 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LHX9Q9NQ69 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms