Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7C4

SYNC, Syncoilin, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNCQ9H7C4 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYNCQ9H7C4 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYNCQ9H7C4 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYNCQ9H7C4 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYNCQ9H7C4 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYNCQ9H7C4 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYNCQ9H7C4 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYNCQ9H7C4 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYNCQ9H7C4 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYNCQ9H7C4 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYNCQ9H7C4 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYNCQ9H7C4 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYNCQ9H7C4 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYNCQ9H7C4 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYNCQ9H7C4 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYNCQ9H7C4 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYNCQ9H7C4 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYNCQ9H7C4 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYNCQ9H7C4 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYNCQ9H7C4 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYNCQ9H7C4 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYNCQ9H7C4 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYNCQ9H7C4 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYNCQ9H7C4 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYNCQ9H7C4 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYNCQ9H7C4 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYNCQ9H7C4 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYNCQ9H7C4 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYNCQ9H7C4 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYNCQ9H7C4 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYNCQ9H7C4 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYNCQ9H7C4 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYNCQ9H7C4 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYNCQ9H7C4 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYNCQ9H7C4 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYNCQ9H7C4 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYNCQ9H7C4 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYNCQ9H7C4 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYNCQ9H7C4 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYNCQ9H7C4 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYNCQ9H7C4 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYNCQ9H7C4 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYNCQ9H7C4 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYNCQ9H7C4 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYNCQ9H7C4 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYNCQ9H7C4 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYNCQ9H7C4 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYNCQ9H7C4 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYNCQ9H7C4 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYNCQ9H7C4 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYNCQ9H7C4 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYNCQ9H7C4 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYNCQ9H7C4 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYNCQ9H7C4 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYNCQ9H7C4 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYNCQ9H7C4 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYNCQ9H7C4 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYNCQ9H7C4 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYNCQ9H7C4 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYNCQ9H7C4 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYNCQ9H7C4 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYNCQ9H7C4 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYNCQ9H7C4 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SYNCQ9H7C4 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYNCQ9H7C4 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SYNCQ9H7C4 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYNCQ9H7C4 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYNCQ9H7C4 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYNCQ9H7C4 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYNCQ9H7C4 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYNCQ9H7C4 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SYNCQ9H7C4 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SYNCQ9H7C4 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SYNCQ9H7C4 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SYNCQ9H7C4 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SYNCQ9H7C4 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SYNCQ9H7C4 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SYNCQ9H7C4 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SYNCQ9H7C4 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SYNCQ9H7C4 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SYNCQ9H7C4 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SYNCQ9H7C4 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SYNCQ9H7C4 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SYNCQ9H7C4 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYNCQ9H7C4 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYNCQ9H7C4 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYNCQ9H7C4 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYNCQ9H7C4 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYNCQ9H7C4 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYNCQ9H7C4 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYNCQ9H7C4 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYNCQ9H7C4 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYNCQ9H7C4 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYNCQ9H7C4 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYNCQ9H7C4 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYNCQ9H7C4 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYNCQ9H7C4 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYNCQ9H7C4 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYNCQ9H7C4 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYNCQ9H7C4 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms