Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2J4

PDCL3, Phosducin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL3Q9H2J4 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDCL3Q9H2J4 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDCL3Q9H2J4 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDCL3Q9H2J4 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDCL3Q9H2J4 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDCL3Q9H2J4 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDCL3Q9H2J4 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDCL3Q9H2J4 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDCL3Q9H2J4 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDCL3Q9H2J4 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDCL3Q9H2J4 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDCL3Q9H2J4 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDCL3Q9H2J4 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PDCL3Q9H2J4 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDCL3Q9H2J4 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDCL3Q9H2J4 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDCL3Q9H2J4 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDCL3Q9H2J4 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDCL3Q9H2J4 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDCL3Q9H2J4 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDCL3Q9H2J4 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDCL3Q9H2J4 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PDCL3Q9H2J4 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDCL3Q9H2J4 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDCL3Q9H2J4 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDCL3Q9H2J4 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDCL3Q9H2J4 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDCL3Q9H2J4 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDCL3Q9H2J4 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PDCL3Q9H2J4 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PDCL3Q9H2J4 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PDCL3Q9H2J4 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PDCL3Q9H2J4 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PDCL3Q9H2J4 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PDCL3Q9H2J4 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PDCL3Q9H2J4 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PDCL3Q9H2J4 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PDCL3Q9H2J4 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PDCL3Q9H2J4 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PDCL3Q9H2J4 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PDCL3Q9H2J4 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PDCL3Q9H2J4 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PDCL3Q9H2J4 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PDCL3Q9H2J4 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
PDCL3Q9H2J4 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PDCL3Q9H2J4 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PDCL3Q9H2J4 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PDCL3Q9H2J4 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PDCL3Q9H2J4 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDCL3Q9H2J4 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDCL3Q9H2J4 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDCL3Q9H2J4 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDCL3Q9H2J4 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDCL3Q9H2J4 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDCL3Q9H2J4 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDCL3Q9H2J4 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDCL3Q9H2J4 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDCL3Q9H2J4 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDCL3Q9H2J4 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDCL3Q9H2J4 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDCL3Q9H2J4 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDCL3Q9H2J4 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDCL3Q9H2J4 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDCL3Q9H2J4 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PDCL3Q9H2J4 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDCL3Q9H2J4 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDCL3Q9H2J4 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDCL3Q9H2J4 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDCL3Q9H2J4 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDCL3Q9H2J4 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDCL3Q9H2J4 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDCL3Q9H2J4 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDCL3Q9H2J4 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDCL3Q9H2J4 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDCL3Q9H2J4 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDCL3Q9H2J4 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDCL3Q9H2J4 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDCL3Q9H2J4 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDCL3Q9H2J4 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDCL3Q9H2J4 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDCL3Q9H2J4 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDCL3Q9H2J4 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDCL3Q9H2J4 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDCL3Q9H2J4 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDCL3Q9H2J4 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDCL3Q9H2J4 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDCL3Q9H2J4 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDCL3Q9H2J4 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDCL3Q9H2J4 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDCL3Q9H2J4 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDCL3Q9H2J4 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDCL3Q9H2J4 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDCL3Q9H2J4 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDCL3Q9H2J4 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDCL3Q9H2J4 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDCL3Q9H2J4 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDCL3Q9H2J4 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDCL3Q9H2J4 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDCL3Q9H2J4 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDCL3Q9H2J4 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms