Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0F6

SHARPIN, Sharpin, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHARPINQ9H0F6 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SHARPINQ9H0F6 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
SHARPINQ9H0F6 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SHARPINQ9H0F6 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SHARPINQ9H0F6 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SHARPINQ9H0F6 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SHARPINQ9H0F6 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SHARPINQ9H0F6 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SHARPINQ9H0F6 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SHARPINQ9H0F6 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SHARPINQ9H0F6 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SHARPINQ9H0F6 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SHARPINQ9H0F6 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SHARPINQ9H0F6 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SHARPINQ9H0F6 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SHARPINQ9H0F6 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SHARPINQ9H0F6 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SHARPINQ9H0F6 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SHARPINQ9H0F6 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SHARPINQ9H0F6 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SHARPINQ9H0F6 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SHARPINQ9H0F6 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SHARPINQ9H0F6 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SHARPINQ9H0F6 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SHARPINQ9H0F6 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SHARPINQ9H0F6 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SHARPINQ9H0F6 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SHARPINQ9H0F6 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SHARPINQ9H0F6 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SHARPINQ9H0F6 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SHARPINQ9H0F6 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SHARPINQ9H0F6 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SHARPINQ9H0F6 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SHARPINQ9H0F6 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SHARPINQ9H0F6 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SHARPINQ9H0F6 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SHARPINQ9H0F6 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SHARPINQ9H0F6 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SHARPINQ9H0F6 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SHARPINQ9H0F6 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SHARPINQ9H0F6 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SHARPINQ9H0F6 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SHARPINQ9H0F6 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SHARPINQ9H0F6 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SHARPINQ9H0F6 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SHARPINQ9H0F6 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SHARPINQ9H0F6 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SHARPINQ9H0F6 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SHARPINQ9H0F6 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SHARPINQ9H0F6 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SHARPINQ9H0F6 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SHARPINQ9H0F6 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SHARPINQ9H0F6 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SHARPINQ9H0F6 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SHARPINQ9H0F6 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SHARPINQ9H0F6 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SHARPINQ9H0F6 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SHARPINQ9H0F6 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SHARPINQ9H0F6 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SHARPINQ9H0F6 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SHARPINQ9H0F6 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SHARPINQ9H0F6 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SHARPINQ9H0F6 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SHARPINQ9H0F6 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SHARPINQ9H0F6 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SHARPINQ9H0F6 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SHARPINQ9H0F6 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SHARPINQ9H0F6 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SHARPINQ9H0F6 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SHARPINQ9H0F6 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SHARPINQ9H0F6 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SHARPINQ9H0F6 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SHARPINQ9H0F6 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SHARPINQ9H0F6 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SHARPINQ9H0F6 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SHARPINQ9H0F6 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SHARPINQ9H0F6 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SHARPINQ9H0F6 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SHARPINQ9H0F6 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SHARPINQ9H0F6 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SHARPINQ9H0F6 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SHARPINQ9H0F6 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SHARPINQ9H0F6 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SHARPINQ9H0F6 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SHARPINQ9H0F6 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SHARPINQ9H0F6 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SHARPINQ9H0F6 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SHARPINQ9H0F6 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SHARPINQ9H0F6 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SHARPINQ9H0F6 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SHARPINQ9H0F6 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SHARPINQ9H0F6 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SHARPINQ9H0F6 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SHARPINQ9H0F6 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SHARPINQ9H0F6 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SHARPINQ9H0F6 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SHARPINQ9H0F6 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SHARPINQ9H0F6 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SHARPINQ9H0F6 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SHARPINQ9H0F6 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms