Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT3

SLIRP, SRA stem-loop-interacting RNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLIRPQ9GZT3 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLIRPQ9GZT3 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLIRPQ9GZT3 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLIRPQ9GZT3 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLIRPQ9GZT3 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLIRPQ9GZT3 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLIRPQ9GZT3 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SLIRPQ9GZT3 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLIRPQ9GZT3 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLIRPQ9GZT3 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLIRPQ9GZT3 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLIRPQ9GZT3 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLIRPQ9GZT3 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLIRPQ9GZT3 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLIRPQ9GZT3 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLIRPQ9GZT3 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLIRPQ9GZT3 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SLIRPQ9GZT3 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLIRPQ9GZT3 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLIRPQ9GZT3 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLIRPQ9GZT3 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLIRPQ9GZT3 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLIRPQ9GZT3 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLIRPQ9GZT3 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLIRPQ9GZT3 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLIRPQ9GZT3 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLIRPQ9GZT3 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLIRPQ9GZT3 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLIRPQ9GZT3 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLIRPQ9GZT3 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLIRPQ9GZT3 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLIRPQ9GZT3 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLIRPQ9GZT3 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLIRPQ9GZT3 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLIRPQ9GZT3 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLIRPQ9GZT3 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLIRPQ9GZT3 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLIRPQ9GZT3 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLIRPQ9GZT3 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SLIRPQ9GZT3 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SLIRPQ9GZT3 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLIRPQ9GZT3 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLIRPQ9GZT3 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLIRPQ9GZT3 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLIRPQ9GZT3 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLIRPQ9GZT3 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLIRPQ9GZT3 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLIRPQ9GZT3 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLIRPQ9GZT3 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLIRPQ9GZT3 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLIRPQ9GZT3 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLIRPQ9GZT3 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLIRPQ9GZT3 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLIRPQ9GZT3 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLIRPQ9GZT3 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLIRPQ9GZT3 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLIRPQ9GZT3 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLIRPQ9GZT3 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLIRPQ9GZT3 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SLIRPQ9GZT3 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SLIRPQ9GZT3 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SLIRPQ9GZT3 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SLIRPQ9GZT3 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SLIRPQ9GZT3 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SLIRPQ9GZT3 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SLIRPQ9GZT3 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SLIRPQ9GZT3 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SLIRPQ9GZT3 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SLIRPQ9GZT3 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SLIRPQ9GZT3 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLIRPQ9GZT3 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLIRPQ9GZT3 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLIRPQ9GZT3 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLIRPQ9GZT3 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLIRPQ9GZT3 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLIRPQ9GZT3 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLIRPQ9GZT3 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLIRPQ9GZT3 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SLIRPQ9GZT3 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLIRPQ9GZT3 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLIRPQ9GZT3 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLIRPQ9GZT3 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLIRPQ9GZT3 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLIRPQ9GZT3 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLIRPQ9GZT3 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLIRPQ9GZT3 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLIRPQ9GZT3 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLIRPQ9GZT3 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLIRPQ9GZT3 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLIRPQ9GZT3 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLIRPQ9GZT3 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLIRPQ9GZT3 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLIRPQ9GZT3 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLIRPQ9GZT3 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLIRPQ9GZT3 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLIRPQ9GZT3 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLIRPQ9GZT3 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLIRPQ9GZT3 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLIRPQ9GZT3 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLIRPQ9GZT3 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms