Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZR1

SENP6, Sentrin-specific protease 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,112 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP6Q9GZR1 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SENP6Q9GZR1 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SENP6Q9GZR1 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SENP6Q9GZR1 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SENP6Q9GZR1 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SENP6Q9GZR1 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SENP6Q9GZR1 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SENP6Q9GZR1 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SENP6Q9GZR1 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SENP6Q9GZR1 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SENP6Q9GZR1 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SENP6Q9GZR1 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
SENP6Q9GZR1 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SENP6Q9GZR1 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SENP6Q9GZR1 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SENP6Q9GZR1 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SENP6Q9GZR1 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SENP6Q9GZR1 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SENP6Q9GZR1 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SENP6Q9GZR1 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SENP6Q9GZR1 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SENP6Q9GZR1 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SENP6Q9GZR1 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SENP6Q9GZR1 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SENP6Q9GZR1 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SENP6Q9GZR1 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SENP6Q9GZR1 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
SENP6Q9GZR1 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SENP6Q9GZR1 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SENP6Q9GZR1 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SENP6Q9GZR1 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SENP6Q9GZR1 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SENP6Q9GZR1 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SENP6Q9GZR1 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SENP6Q9GZR1 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SENP6Q9GZR1 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SENP6Q9GZR1 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SENP6Q9GZR1 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC20.95■□□□□ 0.95
SENP6Q9GZR1 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SENP6Q9GZR1 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SENP6Q9GZR1 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SENP6Q9GZR1 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SENP6Q9GZR1 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
SENP6Q9GZR1 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SENP6Q9GZR1 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SENP6Q9GZR1 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SENP6Q9GZR1 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SENP6Q9GZR1 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SENP6Q9GZR1 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SENP6Q9GZR1 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
SENP6Q9GZR1 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SENP6Q9GZR1 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SENP6Q9GZR1 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SENP6Q9GZR1 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SENP6Q9GZR1 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SENP6Q9GZR1 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SENP6Q9GZR1 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SENP6Q9GZR1 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SENP6Q9GZR1 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SENP6Q9GZR1 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SENP6Q9GZR1 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SENP6Q9GZR1 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SENP6Q9GZR1 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SENP6Q9GZR1 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SENP6Q9GZR1 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SENP6Q9GZR1 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SENP6Q9GZR1 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SENP6Q9GZR1 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SENP6Q9GZR1 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SENP6Q9GZR1 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SENP6Q9GZR1 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SENP6Q9GZR1 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SENP6Q9GZR1 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SENP6Q9GZR1 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SENP6Q9GZR1 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
SENP6Q9GZR1 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SENP6Q9GZR1 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SENP6Q9GZR1 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SENP6Q9GZR1 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SENP6Q9GZR1 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SENP6Q9GZR1 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SENP6Q9GZR1 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SENP6Q9GZR1 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SENP6Q9GZR1 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SENP6Q9GZR1 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SENP6Q9GZR1 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SENP6Q9GZR1 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SENP6Q9GZR1 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SENP6Q9GZR1 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SENP6Q9GZR1 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SENP6Q9GZR1 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SENP6Q9GZR1 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SENP6Q9GZR1 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SENP6Q9GZR1 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SENP6Q9GZR1 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SENP6Q9GZR1 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
SENP6Q9GZR1 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SENP6Q9GZR1 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SENP6Q9GZR1 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SENP6Q9GZR1 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms