Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0H9

SRCIN1, SRC kinase signaling inhibitor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,055 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRCIN1Q9C0H9 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SRCIN1Q9C0H9 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SRCIN1Q9C0H9 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SRCIN1Q9C0H9 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SRCIN1Q9C0H9 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SRCIN1Q9C0H9 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SRCIN1Q9C0H9 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SRCIN1Q9C0H9 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SRCIN1Q9C0H9 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SRCIN1Q9C0H9 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SRCIN1Q9C0H9 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SRCIN1Q9C0H9 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SRCIN1Q9C0H9 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SRCIN1Q9C0H9 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SRCIN1Q9C0H9 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SRCIN1Q9C0H9 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SRCIN1Q9C0H9 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SRCIN1Q9C0H9 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SRCIN1Q9C0H9 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SRCIN1Q9C0H9 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SRCIN1Q9C0H9 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SRCIN1Q9C0H9 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SRCIN1Q9C0H9 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SRCIN1Q9C0H9 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SRCIN1Q9C0H9 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SRCIN1Q9C0H9 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SRCIN1Q9C0H9 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SRCIN1Q9C0H9 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SRCIN1Q9C0H9 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SRCIN1Q9C0H9 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SRCIN1Q9C0H9 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SRCIN1Q9C0H9 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SRCIN1Q9C0H9 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SRCIN1Q9C0H9 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SRCIN1Q9C0H9 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SRCIN1Q9C0H9 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SRCIN1Q9C0H9 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SRCIN1Q9C0H9 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SRCIN1Q9C0H9 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SRCIN1Q9C0H9 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SRCIN1Q9C0H9 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SRCIN1Q9C0H9 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SRCIN1Q9C0H9 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SRCIN1Q9C0H9 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SRCIN1Q9C0H9 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SRCIN1Q9C0H9 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SRCIN1Q9C0H9 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SRCIN1Q9C0H9 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SRCIN1Q9C0H9 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SRCIN1Q9C0H9 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SRCIN1Q9C0H9 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SRCIN1Q9C0H9 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SRCIN1Q9C0H9 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SRCIN1Q9C0H9 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SRCIN1Q9C0H9 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SRCIN1Q9C0H9 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SRCIN1Q9C0H9 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SRCIN1Q9C0H9 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SRCIN1Q9C0H9 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SRCIN1Q9C0H9 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SRCIN1Q9C0H9 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SRCIN1Q9C0H9 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SRCIN1Q9C0H9 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SRCIN1Q9C0H9 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SRCIN1Q9C0H9 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SRCIN1Q9C0H9 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SRCIN1Q9C0H9 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SRCIN1Q9C0H9 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SRCIN1Q9C0H9 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SRCIN1Q9C0H9 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SRCIN1Q9C0H9 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SRCIN1Q9C0H9 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SRCIN1Q9C0H9 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SRCIN1Q9C0H9 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SRCIN1Q9C0H9 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SRCIN1Q9C0H9 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SRCIN1Q9C0H9 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SRCIN1Q9C0H9 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SRCIN1Q9C0H9 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SRCIN1Q9C0H9 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SRCIN1Q9C0H9 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SRCIN1Q9C0H9 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SRCIN1Q9C0H9 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SRCIN1Q9C0H9 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SRCIN1Q9C0H9 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SRCIN1Q9C0H9 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SRCIN1Q9C0H9 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SRCIN1Q9C0H9 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SRCIN1Q9C0H9 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SRCIN1Q9C0H9 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SRCIN1Q9C0H9 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SRCIN1Q9C0H9 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SRCIN1Q9C0H9 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SRCIN1Q9C0H9 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SRCIN1Q9C0H9 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SRCIN1Q9C0H9 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SRCIN1Q9C0H9 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SRCIN1Q9C0H9 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SRCIN1Q9C0H9 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SRCIN1Q9C0H9 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms