Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZQ6

EDEM3, ER degradation-enhancing alpha-mannosidase-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 932 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDEM3Q9BZQ6 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
EDEM3Q9BZQ6 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
EDEM3Q9BZQ6 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
EDEM3Q9BZQ6 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
EDEM3Q9BZQ6 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
EDEM3Q9BZQ6 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
EDEM3Q9BZQ6 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
EDEM3Q9BZQ6 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
EDEM3Q9BZQ6 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
EDEM3Q9BZQ6 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
EDEM3Q9BZQ6 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
EDEM3Q9BZQ6 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
EDEM3Q9BZQ6 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
EDEM3Q9BZQ6 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
EDEM3Q9BZQ6 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
EDEM3Q9BZQ6 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
EDEM3Q9BZQ6 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
EDEM3Q9BZQ6 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
EDEM3Q9BZQ6 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
EDEM3Q9BZQ6 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
EDEM3Q9BZQ6 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
EDEM3Q9BZQ6 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
EDEM3Q9BZQ6 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
EDEM3Q9BZQ6 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
EDEM3Q9BZQ6 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
EDEM3Q9BZQ6 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
EDEM3Q9BZQ6 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
EDEM3Q9BZQ6 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
EDEM3Q9BZQ6 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
EDEM3Q9BZQ6 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
EDEM3Q9BZQ6 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
EDEM3Q9BZQ6 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
EDEM3Q9BZQ6 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
EDEM3Q9BZQ6 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
EDEM3Q9BZQ6 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
EDEM3Q9BZQ6 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
EDEM3Q9BZQ6 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
EDEM3Q9BZQ6 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EDEM3Q9BZQ6 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
EDEM3Q9BZQ6 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
EDEM3Q9BZQ6 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
EDEM3Q9BZQ6 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
EDEM3Q9BZQ6 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
EDEM3Q9BZQ6 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EDEM3Q9BZQ6 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
EDEM3Q9BZQ6 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
EDEM3Q9BZQ6 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
EDEM3Q9BZQ6 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
EDEM3Q9BZQ6 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EDEM3Q9BZQ6 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EDEM3Q9BZQ6 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EDEM3Q9BZQ6 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EDEM3Q9BZQ6 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EDEM3Q9BZQ6 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
EDEM3Q9BZQ6 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EDEM3Q9BZQ6 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EDEM3Q9BZQ6 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
EDEM3Q9BZQ6 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
EDEM3Q9BZQ6 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
EDEM3Q9BZQ6 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
EDEM3Q9BZQ6 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
EDEM3Q9BZQ6 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
EDEM3Q9BZQ6 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
EDEM3Q9BZQ6 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
EDEM3Q9BZQ6 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
EDEM3Q9BZQ6 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
EDEM3Q9BZQ6 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
EDEM3Q9BZQ6 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
EDEM3Q9BZQ6 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
EDEM3Q9BZQ6 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
EDEM3Q9BZQ6 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
EDEM3Q9BZQ6 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
EDEM3Q9BZQ6 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
EDEM3Q9BZQ6 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
EDEM3Q9BZQ6 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
EDEM3Q9BZQ6 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
EDEM3Q9BZQ6 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
EDEM3Q9BZQ6 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
EDEM3Q9BZQ6 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
EDEM3Q9BZQ6 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
EDEM3Q9BZQ6 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
EDEM3Q9BZQ6 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
EDEM3Q9BZQ6 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
EDEM3Q9BZQ6 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
EDEM3Q9BZQ6 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
EDEM3Q9BZQ6 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
EDEM3Q9BZQ6 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
EDEM3Q9BZQ6 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
EDEM3Q9BZQ6 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
EDEM3Q9BZQ6 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
EDEM3Q9BZQ6 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
EDEM3Q9BZQ6 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
EDEM3Q9BZQ6 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
EDEM3Q9BZQ6 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
EDEM3Q9BZQ6 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
EDEM3Q9BZQ6 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
EDEM3Q9BZQ6 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
EDEM3Q9BZQ6 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
EDEM3Q9BZQ6 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
EDEM3Q9BZQ6 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms