Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY41

HDAC8, Histone deacetylase 8, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC8Q9BY41 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HDAC8Q9BY41 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HDAC8Q9BY41 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HDAC8Q9BY41 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HDAC8Q9BY41 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HDAC8Q9BY41 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HDAC8Q9BY41 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HDAC8Q9BY41 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HDAC8Q9BY41 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HDAC8Q9BY41 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HDAC8Q9BY41 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HDAC8Q9BY41 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HDAC8Q9BY41 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HDAC8Q9BY41 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HDAC8Q9BY41 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
HDAC8Q9BY41 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HDAC8Q9BY41 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HDAC8Q9BY41 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HDAC8Q9BY41 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HDAC8Q9BY41 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HDAC8Q9BY41 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HDAC8Q9BY41 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HDAC8Q9BY41 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HDAC8Q9BY41 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HDAC8Q9BY41 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HDAC8Q9BY41 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HDAC8Q9BY41 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HDAC8Q9BY41 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HDAC8Q9BY41 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HDAC8Q9BY41 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HDAC8Q9BY41 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HDAC8Q9BY41 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HDAC8Q9BY41 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HDAC8Q9BY41 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
HDAC8Q9BY41 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HDAC8Q9BY41 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
HDAC8Q9BY41 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HDAC8Q9BY41 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
HDAC8Q9BY41 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HDAC8Q9BY41 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HDAC8Q9BY41 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HDAC8Q9BY41 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HDAC8Q9BY41 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HDAC8Q9BY41 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
HDAC8Q9BY41 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HDAC8Q9BY41 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HDAC8Q9BY41 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HDAC8Q9BY41 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HDAC8Q9BY41 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HDAC8Q9BY41 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HDAC8Q9BY41 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HDAC8Q9BY41 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
HDAC8Q9BY41 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HDAC8Q9BY41 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HDAC8Q9BY41 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HDAC8Q9BY41 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HDAC8Q9BY41 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
HDAC8Q9BY41 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HDAC8Q9BY41 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HDAC8Q9BY41 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HDAC8Q9BY41 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HDAC8Q9BY41 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HDAC8Q9BY41 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
HDAC8Q9BY41 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HDAC8Q9BY41 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
HDAC8Q9BY41 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HDAC8Q9BY41 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
HDAC8Q9BY41 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HDAC8Q9BY41 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HDAC8Q9BY41 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HDAC8Q9BY41 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HDAC8Q9BY41 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HDAC8Q9BY41 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HDAC8Q9BY41 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HDAC8Q9BY41 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HDAC8Q9BY41 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HDAC8Q9BY41 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HDAC8Q9BY41 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HDAC8Q9BY41 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HDAC8Q9BY41 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HDAC8Q9BY41 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HDAC8Q9BY41 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HDAC8Q9BY41 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HDAC8Q9BY41 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HDAC8Q9BY41 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HDAC8Q9BY41 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HDAC8Q9BY41 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HDAC8Q9BY41 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HDAC8Q9BY41 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HDAC8Q9BY41 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HDAC8Q9BY41 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HDAC8Q9BY41 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HDAC8Q9BY41 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HDAC8Q9BY41 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HDAC8Q9BY41 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HDAC8Q9BY41 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HDAC8Q9BY41 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
HDAC8Q9BY41 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
HDAC8Q9BY41 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HDAC8Q9BY41 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms