Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC13.72□□□□□ -0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC13.72□□□□□ -0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC13.72□□□□□ -0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC13.72□□□□□ -0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
MAP1LC3CQ9BXW4 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms