Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWG4

SSBP4, Single-stranded DNA-binding protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP4Q9BWG4 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SSBP4Q9BWG4 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SSBP4Q9BWG4 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SSBP4Q9BWG4 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SSBP4Q9BWG4 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SSBP4Q9BWG4 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SSBP4Q9BWG4 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SSBP4Q9BWG4 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SSBP4Q9BWG4 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SSBP4Q9BWG4 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SSBP4Q9BWG4 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
SSBP4Q9BWG4 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SSBP4Q9BWG4 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SSBP4Q9BWG4 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SSBP4Q9BWG4 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SSBP4Q9BWG4 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SSBP4Q9BWG4 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SSBP4Q9BWG4 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SSBP4Q9BWG4 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SSBP4Q9BWG4 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SSBP4Q9BWG4 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SSBP4Q9BWG4 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SSBP4Q9BWG4 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SSBP4Q9BWG4 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SSBP4Q9BWG4 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
SSBP4Q9BWG4 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SSBP4Q9BWG4 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SSBP4Q9BWG4 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SSBP4Q9BWG4 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
SSBP4Q9BWG4 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SSBP4Q9BWG4 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SSBP4Q9BWG4 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SSBP4Q9BWG4 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SSBP4Q9BWG4 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SSBP4Q9BWG4 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SSBP4Q9BWG4 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SSBP4Q9BWG4 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SSBP4Q9BWG4 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SSBP4Q9BWG4 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SSBP4Q9BWG4 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SSBP4Q9BWG4 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SSBP4Q9BWG4 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SSBP4Q9BWG4 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SSBP4Q9BWG4 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SSBP4Q9BWG4 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SSBP4Q9BWG4 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SSBP4Q9BWG4 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SSBP4Q9BWG4 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SSBP4Q9BWG4 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SSBP4Q9BWG4 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SSBP4Q9BWG4 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SSBP4Q9BWG4 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SSBP4Q9BWG4 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SSBP4Q9BWG4 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SSBP4Q9BWG4 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SSBP4Q9BWG4 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
SSBP4Q9BWG4 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SSBP4Q9BWG4 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SSBP4Q9BWG4 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SSBP4Q9BWG4 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SSBP4Q9BWG4 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SSBP4Q9BWG4 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SSBP4Q9BWG4 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SSBP4Q9BWG4 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SSBP4Q9BWG4 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SSBP4Q9BWG4 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
SSBP4Q9BWG4 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SSBP4Q9BWG4 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SSBP4Q9BWG4 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SSBP4Q9BWG4 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SSBP4Q9BWG4 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SSBP4Q9BWG4 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SSBP4Q9BWG4 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SSBP4Q9BWG4 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SSBP4Q9BWG4 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SSBP4Q9BWG4 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SSBP4Q9BWG4 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SSBP4Q9BWG4 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SSBP4Q9BWG4 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SSBP4Q9BWG4 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SSBP4Q9BWG4 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SSBP4Q9BWG4 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SSBP4Q9BWG4 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SSBP4Q9BWG4 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SSBP4Q9BWG4 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SSBP4Q9BWG4 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SSBP4Q9BWG4 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
SSBP4Q9BWG4 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SSBP4Q9BWG4 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SSBP4Q9BWG4 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SSBP4Q9BWG4 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SSBP4Q9BWG4 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SSBP4Q9BWG4 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SSBP4Q9BWG4 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SSBP4Q9BWG4 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SSBP4Q9BWG4 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SSBP4Q9BWG4 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SSBP4Q9BWG4 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SSBP4Q9BWG4 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SSBP4Q9BWG4 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms