Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NUP58Q9BVL2 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NUP58Q9BVL2 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NUP58Q9BVL2 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NUP58Q9BVL2 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NUP58Q9BVL2 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NUP58Q9BVL2 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NUP58Q9BVL2 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NUP58Q9BVL2 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NUP58Q9BVL2 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NUP58Q9BVL2 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NUP58Q9BVL2 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NUP58Q9BVL2 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NUP58Q9BVL2 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NUP58Q9BVL2 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NUP58Q9BVL2 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NUP58Q9BVL2 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NUP58Q9BVL2 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NUP58Q9BVL2 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NUP58Q9BVL2 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NUP58Q9BVL2 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NUP58Q9BVL2 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NUP58Q9BVL2 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NUP58Q9BVL2 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NUP58Q9BVL2 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
NUP58Q9BVL2 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NUP58Q9BVL2 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NUP58Q9BVL2 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NUP58Q9BVL2 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NUP58Q9BVL2 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NUP58Q9BVL2 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NUP58Q9BVL2 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NUP58Q9BVL2 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NUP58Q9BVL2 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
NUP58Q9BVL2 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NUP58Q9BVL2 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NUP58Q9BVL2 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NUP58Q9BVL2 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
NUP58Q9BVL2 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
NUP58Q9BVL2 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
NUP58Q9BVL2 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
NUP58Q9BVL2 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
NUP58Q9BVL2 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
NUP58Q9BVL2 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
NUP58Q9BVL2 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
NUP58Q9BVL2 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
NUP58Q9BVL2 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
NUP58Q9BVL2 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NUP58Q9BVL2 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NUP58Q9BVL2 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NUP58Q9BVL2 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NUP58Q9BVL2 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NUP58Q9BVL2 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NUP58Q9BVL2 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NUP58Q9BVL2 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NUP58Q9BVL2 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NUP58Q9BVL2 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NUP58Q9BVL2 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NUP58Q9BVL2 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NUP58Q9BVL2 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NUP58Q9BVL2 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
NUP58Q9BVL2 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
NUP58Q9BVL2 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NUP58Q9BVL2 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NUP58Q9BVL2 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NUP58Q9BVL2 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NUP58Q9BVL2 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
NUP58Q9BVL2 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NUP58Q9BVL2 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NUP58Q9BVL2 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NUP58Q9BVL2 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NUP58Q9BVL2 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NUP58Q9BVL2 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NUP58Q9BVL2 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NUP58Q9BVL2 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NUP58Q9BVL2 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NUP58Q9BVL2 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NUP58Q9BVL2 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NUP58Q9BVL2 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
NUP58Q9BVL2 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NUP58Q9BVL2 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NUP58Q9BVL2 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NUP58Q9BVL2 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NUP58Q9BVL2 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NUP58Q9BVL2 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NUP58Q9BVL2 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NUP58Q9BVL2 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NUP58Q9BVL2 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NUP58Q9BVL2 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NUP58Q9BVL2 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NUP58Q9BVL2 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NUP58Q9BVL2 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NUP58Q9BVL2 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NUP58Q9BVL2 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NUP58Q9BVL2 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
NUP58Q9BVL2 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NUP58Q9BVL2 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NUP58Q9BVL2 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NUP58Q9BVL2 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
NUP58Q9BVL2 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms