Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV29

CCDC32, Coiled-coil domain-containing protein 32, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC32Q9BV29 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC32Q9BV29 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC32Q9BV29 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC32Q9BV29 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC32Q9BV29 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC32Q9BV29 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC32Q9BV29 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC32Q9BV29 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC32Q9BV29 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC32Q9BV29 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC32Q9BV29 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC32Q9BV29 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC32Q9BV29 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC32Q9BV29 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC32Q9BV29 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC32Q9BV29 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC32Q9BV29 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC32Q9BV29 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC32Q9BV29 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC32Q9BV29 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC32Q9BV29 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC32Q9BV29 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC32Q9BV29 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC32Q9BV29 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC32Q9BV29 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC32Q9BV29 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC32Q9BV29 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC32Q9BV29 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC32Q9BV29 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC32Q9BV29 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC32Q9BV29 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC32Q9BV29 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC32Q9BV29 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC32Q9BV29 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC32Q9BV29 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC32Q9BV29 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC32Q9BV29 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC32Q9BV29 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC32Q9BV29 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC32Q9BV29 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC32Q9BV29 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC32Q9BV29 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC32Q9BV29 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC32Q9BV29 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC32Q9BV29 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC32Q9BV29 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC32Q9BV29 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC32Q9BV29 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC32Q9BV29 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
CCDC32Q9BV29 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC32Q9BV29 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC32Q9BV29 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC32Q9BV29 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC32Q9BV29 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC32Q9BV29 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC32Q9BV29 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC32Q9BV29 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC32Q9BV29 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC32Q9BV29 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC32Q9BV29 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC32Q9BV29 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC32Q9BV29 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC32Q9BV29 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC32Q9BV29 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC32Q9BV29 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC32Q9BV29 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC32Q9BV29 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC32Q9BV29 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC32Q9BV29 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC32Q9BV29 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC32Q9BV29 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC32Q9BV29 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC32Q9BV29 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC32Q9BV29 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC32Q9BV29 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC32Q9BV29 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC32Q9BV29 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC32Q9BV29 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC32Q9BV29 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC32Q9BV29 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC32Q9BV29 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC32Q9BV29 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC32Q9BV29 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC32Q9BV29 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC32Q9BV29 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC32Q9BV29 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC32Q9BV29 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC32Q9BV29 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC32Q9BV29 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC32Q9BV29 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC32Q9BV29 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC32Q9BV29 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC32Q9BV29 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC32Q9BV29 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC32Q9BV29 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC32Q9BV29 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC32Q9BV29 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC32Q9BV29 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC32Q9BV29 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC32Q9BV29 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms