Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUW7

C9orf16, UPF0184 protein C9orf16, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16Q9BUW7 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
C9orf16Q9BUW7 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
C9orf16Q9BUW7 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
C9orf16Q9BUW7 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
C9orf16Q9BUW7 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
C9orf16Q9BUW7 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C9orf16Q9BUW7 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C9orf16Q9BUW7 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
C9orf16Q9BUW7 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C9orf16Q9BUW7 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
C9orf16Q9BUW7 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
C9orf16Q9BUW7 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C9orf16Q9BUW7 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
C9orf16Q9BUW7 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C9orf16Q9BUW7 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
C9orf16Q9BUW7 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
C9orf16Q9BUW7 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C9orf16Q9BUW7 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
C9orf16Q9BUW7 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
C9orf16Q9BUW7 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
C9orf16Q9BUW7 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
C9orf16Q9BUW7 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
C9orf16Q9BUW7 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C9orf16Q9BUW7 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
C9orf16Q9BUW7 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
C9orf16Q9BUW7 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
C9orf16Q9BUW7 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C9orf16Q9BUW7 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C9orf16Q9BUW7 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
C9orf16Q9BUW7 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C9orf16Q9BUW7 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
C9orf16Q9BUW7 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C9orf16Q9BUW7 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C9orf16Q9BUW7 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
C9orf16Q9BUW7 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
C9orf16Q9BUW7 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C9orf16Q9BUW7 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C9orf16Q9BUW7 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
C9orf16Q9BUW7 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
C9orf16Q9BUW7 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
C9orf16Q9BUW7 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
C9orf16Q9BUW7 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
C9orf16Q9BUW7 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
C9orf16Q9BUW7 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
C9orf16Q9BUW7 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
C9orf16Q9BUW7 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
C9orf16Q9BUW7 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
C9orf16Q9BUW7 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
C9orf16Q9BUW7 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
C9orf16Q9BUW7 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
C9orf16Q9BUW7 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
C9orf16Q9BUW7 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
C9orf16Q9BUW7 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
C9orf16Q9BUW7 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
C9orf16Q9BUW7 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
C9orf16Q9BUW7 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
C9orf16Q9BUW7 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
C9orf16Q9BUW7 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
C9orf16Q9BUW7 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
C9orf16Q9BUW7 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
C9orf16Q9BUW7 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
C9orf16Q9BUW7 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
C9orf16Q9BUW7 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
C9orf16Q9BUW7 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
C9orf16Q9BUW7 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
C9orf16Q9BUW7 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
C9orf16Q9BUW7 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
C9orf16Q9BUW7 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
C9orf16Q9BUW7 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
C9orf16Q9BUW7 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
C9orf16Q9BUW7 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
C9orf16Q9BUW7 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
C9orf16Q9BUW7 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
C9orf16Q9BUW7 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
C9orf16Q9BUW7 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
C9orf16Q9BUW7 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
C9orf16Q9BUW7 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
C9orf16Q9BUW7 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
C9orf16Q9BUW7 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
C9orf16Q9BUW7 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
C9orf16Q9BUW7 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
C9orf16Q9BUW7 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
C9orf16Q9BUW7 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
C9orf16Q9BUW7 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
C9orf16Q9BUW7 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
C9orf16Q9BUW7 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
C9orf16Q9BUW7 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
C9orf16Q9BUW7 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
C9orf16Q9BUW7 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
C9orf16Q9BUW7 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
C9orf16Q9BUW7 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
C9orf16Q9BUW7 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C9orf16Q9BUW7 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C9orf16Q9BUW7 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C9orf16Q9BUW7 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
C9orf16Q9BUW7 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C9orf16Q9BUW7 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C9orf16Q9BUW7 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C9orf16Q9BUW7 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
C9orf16Q9BUW7 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms