Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRN9

TM2D3, TM2 domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 247 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM2D3Q9BRN9 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TM2D3Q9BRN9 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TM2D3Q9BRN9 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TM2D3Q9BRN9 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TM2D3Q9BRN9 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
TM2D3Q9BRN9 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TM2D3Q9BRN9 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TM2D3Q9BRN9 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TM2D3Q9BRN9 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TM2D3Q9BRN9 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TM2D3Q9BRN9 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TM2D3Q9BRN9 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TM2D3Q9BRN9 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TM2D3Q9BRN9 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TM2D3Q9BRN9 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TM2D3Q9BRN9 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TM2D3Q9BRN9 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TM2D3Q9BRN9 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TM2D3Q9BRN9 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TM2D3Q9BRN9 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TM2D3Q9BRN9 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TM2D3Q9BRN9 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TM2D3Q9BRN9 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
TM2D3Q9BRN9 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TM2D3Q9BRN9 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TM2D3Q9BRN9 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TM2D3Q9BRN9 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TM2D3Q9BRN9 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TM2D3Q9BRN9 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TM2D3Q9BRN9 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TM2D3Q9BRN9 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TM2D3Q9BRN9 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TM2D3Q9BRN9 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TM2D3Q9BRN9 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TM2D3Q9BRN9 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TM2D3Q9BRN9 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TM2D3Q9BRN9 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TM2D3Q9BRN9 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TM2D3Q9BRN9 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TM2D3Q9BRN9 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TM2D3Q9BRN9 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TM2D3Q9BRN9 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
TM2D3Q9BRN9 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
TM2D3Q9BRN9 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TM2D3Q9BRN9 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TM2D3Q9BRN9 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TM2D3Q9BRN9 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
TM2D3Q9BRN9 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
TM2D3Q9BRN9 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TM2D3Q9BRN9 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
TM2D3Q9BRN9 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TM2D3Q9BRN9 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TM2D3Q9BRN9 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
TM2D3Q9BRN9 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TM2D3Q9BRN9 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TM2D3Q9BRN9 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TM2D3Q9BRN9 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TM2D3Q9BRN9 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TM2D3Q9BRN9 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TM2D3Q9BRN9 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TM2D3Q9BRN9 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TM2D3Q9BRN9 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TM2D3Q9BRN9 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TM2D3Q9BRN9 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TM2D3Q9BRN9 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TM2D3Q9BRN9 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TM2D3Q9BRN9 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TM2D3Q9BRN9 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TM2D3Q9BRN9 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TM2D3Q9BRN9 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TM2D3Q9BRN9 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TM2D3Q9BRN9 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TM2D3Q9BRN9 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TM2D3Q9BRN9 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TM2D3Q9BRN9 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TM2D3Q9BRN9 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TM2D3Q9BRN9 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
TM2D3Q9BRN9 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TM2D3Q9BRN9 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TM2D3Q9BRN9 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TM2D3Q9BRN9 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
TM2D3Q9BRN9 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
TM2D3Q9BRN9 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
TM2D3Q9BRN9 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TM2D3Q9BRN9 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TM2D3Q9BRN9 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TM2D3Q9BRN9 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TM2D3Q9BRN9 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TM2D3Q9BRN9 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TM2D3Q9BRN9 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TM2D3Q9BRN9 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TM2D3Q9BRN9 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TM2D3Q9BRN9 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TM2D3Q9BRN9 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TM2D3Q9BRN9 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TM2D3Q9BRN9 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TM2D3Q9BRN9 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TM2D3Q9BRN9 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TM2D3Q9BRN9 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TM2D3Q9BRN9 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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