Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ31

KCNS3, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 3, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNS3Q9BQ31 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
KCNS3Q9BQ31 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KCNS3Q9BQ31 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KCNS3Q9BQ31 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KCNS3Q9BQ31 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KCNS3Q9BQ31 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KCNS3Q9BQ31 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KCNS3Q9BQ31 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KCNS3Q9BQ31 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KCNS3Q9BQ31 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KCNS3Q9BQ31 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KCNS3Q9BQ31 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KCNS3Q9BQ31 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KCNS3Q9BQ31 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KCNS3Q9BQ31 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KCNS3Q9BQ31 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KCNS3Q9BQ31 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
KCNS3Q9BQ31 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KCNS3Q9BQ31 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KCNS3Q9BQ31 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KCNS3Q9BQ31 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KCNS3Q9BQ31 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KCNS3Q9BQ31 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KCNS3Q9BQ31 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KCNS3Q9BQ31 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KCNS3Q9BQ31 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KCNS3Q9BQ31 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KCNS3Q9BQ31 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
KCNS3Q9BQ31 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KCNS3Q9BQ31 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KCNS3Q9BQ31 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
KCNS3Q9BQ31 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KCNS3Q9BQ31 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KCNS3Q9BQ31 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KCNS3Q9BQ31 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KCNS3Q9BQ31 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KCNS3Q9BQ31 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KCNS3Q9BQ31 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KCNS3Q9BQ31 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KCNS3Q9BQ31 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KCNS3Q9BQ31 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KCNS3Q9BQ31 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KCNS3Q9BQ31 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KCNS3Q9BQ31 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KCNS3Q9BQ31 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KCNS3Q9BQ31 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KCNS3Q9BQ31 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KCNS3Q9BQ31 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KCNS3Q9BQ31 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KCNS3Q9BQ31 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNS3Q9BQ31 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNS3Q9BQ31 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNS3Q9BQ31 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNS3Q9BQ31 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNS3Q9BQ31 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNS3Q9BQ31 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNS3Q9BQ31 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNS3Q9BQ31 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNS3Q9BQ31 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNS3Q9BQ31 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNS3Q9BQ31 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNS3Q9BQ31 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNS3Q9BQ31 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNS3Q9BQ31 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNS3Q9BQ31 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNS3Q9BQ31 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNS3Q9BQ31 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNS3Q9BQ31 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNS3Q9BQ31 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNS3Q9BQ31 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNS3Q9BQ31 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNS3Q9BQ31 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNS3Q9BQ31 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNS3Q9BQ31 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNS3Q9BQ31 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNS3Q9BQ31 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNS3Q9BQ31 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNS3Q9BQ31 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNS3Q9BQ31 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNS3Q9BQ31 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNS3Q9BQ31 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNS3Q9BQ31 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNS3Q9BQ31 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNS3Q9BQ31 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNS3Q9BQ31 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNS3Q9BQ31 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNS3Q9BQ31 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNS3Q9BQ31 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNS3Q9BQ31 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNS3Q9BQ31 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNS3Q9BQ31 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNS3Q9BQ31 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNS3Q9BQ31 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNS3Q9BQ31 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNS3Q9BQ31 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNS3Q9BQ31 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNS3Q9BQ31 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNS3Q9BQ31 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNS3Q9BQ31 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNS3Q9BQ31 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms