Protein–RNA interactions for Protein: Q99836

MYD88, Myeloid differentiation primary response protein MyD88, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYD88Q99836 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
MYD88Q99836 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MYD88Q99836 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MYD88Q99836 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MYD88Q99836 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MYD88Q99836 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MYD88Q99836 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MYD88Q99836 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MYD88Q99836 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MYD88Q99836 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MYD88Q99836 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MYD88Q99836 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MYD88Q99836 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
MYD88Q99836 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MYD88Q99836 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MYD88Q99836 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MYD88Q99836 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MYD88Q99836 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MYD88Q99836 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MYD88Q99836 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MYD88Q99836 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MYD88Q99836 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MYD88Q99836 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MYD88Q99836 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
MYD88Q99836 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MYD88Q99836 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MYD88Q99836 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MYD88Q99836 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MYD88Q99836 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
MYD88Q99836 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MYD88Q99836 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MYD88Q99836 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MYD88Q99836 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MYD88Q99836 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MYD88Q99836 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MYD88Q99836 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MYD88Q99836 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MYD88Q99836 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MYD88Q99836 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MYD88Q99836 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MYD88Q99836 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MYD88Q99836 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MYD88Q99836 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MYD88Q99836 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MYD88Q99836 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MYD88Q99836 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MYD88Q99836 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MYD88Q99836 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MYD88Q99836 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MYD88Q99836 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MYD88Q99836 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MYD88Q99836 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MYD88Q99836 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MYD88Q99836 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
MYD88Q99836 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MYD88Q99836 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
MYD88Q99836 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MYD88Q99836 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MYD88Q99836 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MYD88Q99836 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MYD88Q99836 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MYD88Q99836 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MYD88Q99836 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MYD88Q99836 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MYD88Q99836 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MYD88Q99836 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MYD88Q99836 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MYD88Q99836 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MYD88Q99836 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MYD88Q99836 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MYD88Q99836 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MYD88Q99836 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MYD88Q99836 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MYD88Q99836 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MYD88Q99836 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MYD88Q99836 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
MYD88Q99836 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MYD88Q99836 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MYD88Q99836 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MYD88Q99836 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MYD88Q99836 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MYD88Q99836 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MYD88Q99836 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MYD88Q99836 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MYD88Q99836 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MYD88Q99836 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MYD88Q99836 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MYD88Q99836 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MYD88Q99836 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MYD88Q99836 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MYD88Q99836 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MYD88Q99836 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
MYD88Q99836 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MYD88Q99836 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MYD88Q99836 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MYD88Q99836 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MYD88Q99836 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
MYD88Q99836 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MYD88Q99836 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
MYD88Q99836 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms