Protein–RNA interactions for Protein: Q99616

CCL13, C-C motif chemokine 13, humanhuman

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL13Q99616 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCL13Q99616 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCL13Q99616 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCL13Q99616 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCL13Q99616 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCL13Q99616 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCL13Q99616 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCL13Q99616 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCL13Q99616 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCL13Q99616 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCL13Q99616 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCL13Q99616 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCL13Q99616 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCL13Q99616 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCL13Q99616 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCL13Q99616 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCL13Q99616 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCL13Q99616 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCL13Q99616 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCL13Q99616 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCL13Q99616 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCL13Q99616 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCL13Q99616 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCL13Q99616 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCL13Q99616 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CCL13Q99616 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCL13Q99616 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCL13Q99616 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCL13Q99616 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCL13Q99616 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCL13Q99616 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCL13Q99616 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCL13Q99616 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCL13Q99616 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCL13Q99616 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCL13Q99616 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCL13Q99616 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCL13Q99616 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCL13Q99616 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCL13Q99616 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCL13Q99616 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCL13Q99616 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCL13Q99616 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCL13Q99616 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCL13Q99616 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCL13Q99616 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCL13Q99616 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCL13Q99616 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCL13Q99616 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCL13Q99616 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCL13Q99616 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CCL13Q99616 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CCL13Q99616 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CCL13Q99616 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCL13Q99616 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCL13Q99616 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCL13Q99616 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CCL13Q99616 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CCL13Q99616 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCL13Q99616 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCL13Q99616 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CCL13Q99616 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCL13Q99616 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCL13Q99616 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCL13Q99616 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCL13Q99616 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCL13Q99616 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCL13Q99616 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCL13Q99616 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCL13Q99616 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCL13Q99616 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCL13Q99616 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCL13Q99616 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCL13Q99616 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCL13Q99616 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CCL13Q99616 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCL13Q99616 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCL13Q99616 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCL13Q99616 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCL13Q99616 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCL13Q99616 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCL13Q99616 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CCL13Q99616 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCL13Q99616 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCL13Q99616 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCL13Q99616 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCL13Q99616 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCL13Q99616 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCL13Q99616 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCL13Q99616 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCL13Q99616 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCL13Q99616 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCL13Q99616 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CCL13Q99616 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCL13Q99616 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCL13Q99616 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCL13Q99616 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCL13Q99616 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCL13Q99616 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCL13Q99616 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms