Protein–RNA interactions for Protein: Q99453

PHOX2B, Paired mesoderm homeobox protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHOX2BQ99453 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PHOX2BQ99453 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PHOX2BQ99453 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PHOX2BQ99453 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PHOX2BQ99453 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PHOX2BQ99453 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PHOX2BQ99453 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PHOX2BQ99453 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PHOX2BQ99453 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PHOX2BQ99453 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PHOX2BQ99453 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PHOX2BQ99453 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PHOX2BQ99453 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PHOX2BQ99453 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
PHOX2BQ99453 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PHOX2BQ99453 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PHOX2BQ99453 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PHOX2BQ99453 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PHOX2BQ99453 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PHOX2BQ99453 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PHOX2BQ99453 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PHOX2BQ99453 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PHOX2BQ99453 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PHOX2BQ99453 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PHOX2BQ99453 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PHOX2BQ99453 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PHOX2BQ99453 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PHOX2BQ99453 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PHOX2BQ99453 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PHOX2BQ99453 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PHOX2BQ99453 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
PHOX2BQ99453 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PHOX2BQ99453 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PHOX2BQ99453 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PHOX2BQ99453 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PHOX2BQ99453 AC120057.1-201ENST00000483947 663 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
PHOX2BQ99453 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PHOX2BQ99453 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PHOX2BQ99453 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PHOX2BQ99453 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PHOX2BQ99453 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PHOX2BQ99453 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PHOX2BQ99453 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PHOX2BQ99453 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PHOX2BQ99453 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PHOX2BQ99453 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PHOX2BQ99453 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PHOX2BQ99453 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PHOX2BQ99453 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PHOX2BQ99453 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PHOX2BQ99453 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PHOX2BQ99453 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PHOX2BQ99453 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PHOX2BQ99453 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PHOX2BQ99453 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PHOX2BQ99453 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PHOX2BQ99453 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PHOX2BQ99453 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PHOX2BQ99453 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PHOX2BQ99453 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PHOX2BQ99453 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PHOX2BQ99453 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
PHOX2BQ99453 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PHOX2BQ99453 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PHOX2BQ99453 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PHOX2BQ99453 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
PHOX2BQ99453 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PHOX2BQ99453 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PHOX2BQ99453 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PHOX2BQ99453 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PHOX2BQ99453 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PHOX2BQ99453 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PHOX2BQ99453 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PHOX2BQ99453 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PHOX2BQ99453 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PHOX2BQ99453 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PHOX2BQ99453 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PHOX2BQ99453 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PHOX2BQ99453 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PHOX2BQ99453 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PHOX2BQ99453 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
PHOX2BQ99453 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PHOX2BQ99453 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PHOX2BQ99453 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PHOX2BQ99453 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PHOX2BQ99453 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PHOX2BQ99453 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PHOX2BQ99453 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PHOX2BQ99453 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PHOX2BQ99453 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
PHOX2BQ99453 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PHOX2BQ99453 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PHOX2BQ99453 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PHOX2BQ99453 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PHOX2BQ99453 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PHOX2BQ99453 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PHOX2BQ99453 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PHOX2BQ99453 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PHOX2BQ99453 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PHOX2BQ99453 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.1 ms