Protein–RNA interactions for Protein: Q96SN8

CDK5RAP2, CDK5 regulatory subunit-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,893 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP2Q96SN8 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDK5RAP2Q96SN8 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDK5RAP2Q96SN8 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDK5RAP2Q96SN8 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDK5RAP2Q96SN8 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDK5RAP2Q96SN8 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDK5RAP2Q96SN8 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDK5RAP2Q96SN8 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDK5RAP2Q96SN8 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDK5RAP2Q96SN8 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDK5RAP2Q96SN8 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDK5RAP2Q96SN8 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDK5RAP2Q96SN8 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDK5RAP2Q96SN8 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDK5RAP2Q96SN8 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDK5RAP2Q96SN8 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDK5RAP2Q96SN8 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CDK5RAP2Q96SN8 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDK5RAP2Q96SN8 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDK5RAP2Q96SN8 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CDK5RAP2Q96SN8 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDK5RAP2Q96SN8 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDK5RAP2Q96SN8 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDK5RAP2Q96SN8 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDK5RAP2Q96SN8 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDK5RAP2Q96SN8 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDK5RAP2Q96SN8 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDK5RAP2Q96SN8 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDK5RAP2Q96SN8 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDK5RAP2Q96SN8 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CDK5RAP2Q96SN8 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDK5RAP2Q96SN8 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDK5RAP2Q96SN8 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDK5RAP2Q96SN8 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDK5RAP2Q96SN8 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDK5RAP2Q96SN8 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDK5RAP2Q96SN8 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CDK5RAP2Q96SN8 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDK5RAP2Q96SN8 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDK5RAP2Q96SN8 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDK5RAP2Q96SN8 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDK5RAP2Q96SN8 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDK5RAP2Q96SN8 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDK5RAP2Q96SN8 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDK5RAP2Q96SN8 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDK5RAP2Q96SN8 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDK5RAP2Q96SN8 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CDK5RAP2Q96SN8 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDK5RAP2Q96SN8 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDK5RAP2Q96SN8 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDK5RAP2Q96SN8 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDK5RAP2Q96SN8 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDK5RAP2Q96SN8 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDK5RAP2Q96SN8 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDK5RAP2Q96SN8 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDK5RAP2Q96SN8 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDK5RAP2Q96SN8 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDK5RAP2Q96SN8 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDK5RAP2Q96SN8 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDK5RAP2Q96SN8 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDK5RAP2Q96SN8 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CDK5RAP2Q96SN8 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDK5RAP2Q96SN8 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDK5RAP2Q96SN8 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CDK5RAP2Q96SN8 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDK5RAP2Q96SN8 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CDK5RAP2Q96SN8 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDK5RAP2Q96SN8 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDK5RAP2Q96SN8 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDK5RAP2Q96SN8 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDK5RAP2Q96SN8 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDK5RAP2Q96SN8 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDK5RAP2Q96SN8 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDK5RAP2Q96SN8 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDK5RAP2Q96SN8 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDK5RAP2Q96SN8 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDK5RAP2Q96SN8 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDK5RAP2Q96SN8 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CDK5RAP2Q96SN8 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDK5RAP2Q96SN8 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDK5RAP2Q96SN8 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDK5RAP2Q96SN8 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDK5RAP2Q96SN8 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDK5RAP2Q96SN8 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDK5RAP2Q96SN8 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDK5RAP2Q96SN8 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDK5RAP2Q96SN8 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDK5RAP2Q96SN8 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDK5RAP2Q96SN8 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDK5RAP2Q96SN8 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDK5RAP2Q96SN8 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDK5RAP2Q96SN8 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDK5RAP2Q96SN8 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDK5RAP2Q96SN8 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDK5RAP2Q96SN8 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDK5RAP2Q96SN8 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDK5RAP2Q96SN8 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDK5RAP2Q96SN8 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDK5RAP2Q96SN8 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CDK5RAP2Q96SN8 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms