Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN3

PKNOX2, Homeobox protein PKNOX2, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKNOX2Q96KN3 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PKNOX2Q96KN3 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PKNOX2Q96KN3 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PKNOX2Q96KN3 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PKNOX2Q96KN3 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PKNOX2Q96KN3 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PKNOX2Q96KN3 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PKNOX2Q96KN3 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PKNOX2Q96KN3 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PKNOX2Q96KN3 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PKNOX2Q96KN3 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PKNOX2Q96KN3 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PKNOX2Q96KN3 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PKNOX2Q96KN3 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PKNOX2Q96KN3 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PKNOX2Q96KN3 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PKNOX2Q96KN3 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PKNOX2Q96KN3 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PKNOX2Q96KN3 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PKNOX2Q96KN3 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PKNOX2Q96KN3 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PKNOX2Q96KN3 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PKNOX2Q96KN3 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PKNOX2Q96KN3 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PKNOX2Q96KN3 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PKNOX2Q96KN3 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PKNOX2Q96KN3 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PKNOX2Q96KN3 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PKNOX2Q96KN3 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PKNOX2Q96KN3 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PKNOX2Q96KN3 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PKNOX2Q96KN3 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PKNOX2Q96KN3 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PKNOX2Q96KN3 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PKNOX2Q96KN3 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PKNOX2Q96KN3 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PKNOX2Q96KN3 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PKNOX2Q96KN3 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PKNOX2Q96KN3 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PKNOX2Q96KN3 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PKNOX2Q96KN3 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PKNOX2Q96KN3 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PKNOX2Q96KN3 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PKNOX2Q96KN3 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PKNOX2Q96KN3 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PKNOX2Q96KN3 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PKNOX2Q96KN3 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PKNOX2Q96KN3 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PKNOX2Q96KN3 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PKNOX2Q96KN3 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PKNOX2Q96KN3 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PKNOX2Q96KN3 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PKNOX2Q96KN3 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PKNOX2Q96KN3 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PKNOX2Q96KN3 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PKNOX2Q96KN3 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PKNOX2Q96KN3 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PKNOX2Q96KN3 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PKNOX2Q96KN3 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PKNOX2Q96KN3 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PKNOX2Q96KN3 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PKNOX2Q96KN3 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PKNOX2Q96KN3 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PKNOX2Q96KN3 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PKNOX2Q96KN3 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PKNOX2Q96KN3 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PKNOX2Q96KN3 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PKNOX2Q96KN3 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PKNOX2Q96KN3 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PKNOX2Q96KN3 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PKNOX2Q96KN3 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PKNOX2Q96KN3 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PKNOX2Q96KN3 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PKNOX2Q96KN3 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PKNOX2Q96KN3 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PKNOX2Q96KN3 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PKNOX2Q96KN3 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PKNOX2Q96KN3 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PKNOX2Q96KN3 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PKNOX2Q96KN3 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PKNOX2Q96KN3 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PKNOX2Q96KN3 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PKNOX2Q96KN3 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PKNOX2Q96KN3 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PKNOX2Q96KN3 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PKNOX2Q96KN3 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PKNOX2Q96KN3 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PKNOX2Q96KN3 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PKNOX2Q96KN3 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PKNOX2Q96KN3 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PKNOX2Q96KN3 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PKNOX2Q96KN3 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PKNOX2Q96KN3 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PKNOX2Q96KN3 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PKNOX2Q96KN3 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PKNOX2Q96KN3 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PKNOX2Q96KN3 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PKNOX2Q96KN3 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PKNOX2Q96KN3 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PKNOX2Q96KN3 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms