Protein–RNA interactions for Protein: Q96JG8

MAGED4, Melanoma-associated antigen D4, humanhuman

Predictions only

Length 741 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAGED4Q96JG8 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MAGED4Q96JG8 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MAGED4Q96JG8 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MAGED4Q96JG8 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MAGED4Q96JG8 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MAGED4Q96JG8 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MAGED4Q96JG8 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MAGED4Q96JG8 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MAGED4Q96JG8 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MAGED4Q96JG8 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MAGED4Q96JG8 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MAGED4Q96JG8 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
MAGED4Q96JG8 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MAGED4Q96JG8 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
MAGED4Q96JG8 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MAGED4Q96JG8 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
MAGED4Q96JG8 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MAGED4Q96JG8 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MAGED4Q96JG8 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MAGED4Q96JG8 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MAGED4Q96JG8 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MAGED4Q96JG8 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
MAGED4Q96JG8 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MAGED4Q96JG8 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MAGED4Q96JG8 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MAGED4Q96JG8 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MAGED4Q96JG8 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MAGED4Q96JG8 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MAGED4Q96JG8 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MAGED4Q96JG8 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MAGED4Q96JG8 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MAGED4Q96JG8 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MAGED4Q96JG8 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MAGED4Q96JG8 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MAGED4Q96JG8 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MAGED4Q96JG8 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MAGED4Q96JG8 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MAGED4Q96JG8 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MAGED4Q96JG8 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MAGED4Q96JG8 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MAGED4Q96JG8 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MAGED4Q96JG8 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MAGED4Q96JG8 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MAGED4Q96JG8 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MAGED4Q96JG8 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MAGED4Q96JG8 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MAGED4Q96JG8 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MAGED4Q96JG8 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MAGED4Q96JG8 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MAGED4Q96JG8 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MAGED4Q96JG8 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MAGED4Q96JG8 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MAGED4Q96JG8 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MAGED4Q96JG8 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MAGED4Q96JG8 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MAGED4Q96JG8 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MAGED4Q96JG8 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MAGED4Q96JG8 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MAGED4Q96JG8 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MAGED4Q96JG8 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MAGED4Q96JG8 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MAGED4Q96JG8 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MAGED4Q96JG8 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MAGED4Q96JG8 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MAGED4Q96JG8 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MAGED4Q96JG8 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MAGED4Q96JG8 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MAGED4Q96JG8 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MAGED4Q96JG8 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MAGED4Q96JG8 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MAGED4Q96JG8 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MAGED4Q96JG8 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MAGED4Q96JG8 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MAGED4Q96JG8 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MAGED4Q96JG8 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MAGED4Q96JG8 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MAGED4Q96JG8 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MAGED4Q96JG8 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
MAGED4Q96JG8 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MAGED4Q96JG8 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MAGED4Q96JG8 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MAGED4Q96JG8 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MAGED4Q96JG8 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MAGED4Q96JG8 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MAGED4Q96JG8 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MAGED4Q96JG8 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MAGED4Q96JG8 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MAGED4Q96JG8 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MAGED4Q96JG8 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MAGED4Q96JG8 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MAGED4Q96JG8 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MAGED4Q96JG8 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MAGED4Q96JG8 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MAGED4Q96JG8 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MAGED4Q96JG8 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MAGED4Q96JG8 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MAGED4Q96JG8 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MAGED4Q96JG8 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
MAGED4Q96JG8 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MAGED4Q96JG8 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms