Protein–RNA interactions for Protein: Q96IW2

SHD, SH2 domain-containing adapter protein D, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHDQ96IW2 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SHDQ96IW2 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SHDQ96IW2 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SHDQ96IW2 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SHDQ96IW2 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SHDQ96IW2 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SHDQ96IW2 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SHDQ96IW2 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SHDQ96IW2 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SHDQ96IW2 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SHDQ96IW2 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SHDQ96IW2 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SHDQ96IW2 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SHDQ96IW2 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SHDQ96IW2 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SHDQ96IW2 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SHDQ96IW2 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SHDQ96IW2 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SHDQ96IW2 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SHDQ96IW2 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SHDQ96IW2 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SHDQ96IW2 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SHDQ96IW2 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SHDQ96IW2 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SHDQ96IW2 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SHDQ96IW2 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SHDQ96IW2 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SHDQ96IW2 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SHDQ96IW2 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SHDQ96IW2 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SHDQ96IW2 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SHDQ96IW2 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SHDQ96IW2 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SHDQ96IW2 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SHDQ96IW2 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SHDQ96IW2 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SHDQ96IW2 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SHDQ96IW2 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SHDQ96IW2 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SHDQ96IW2 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SHDQ96IW2 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SHDQ96IW2 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SHDQ96IW2 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SHDQ96IW2 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SHDQ96IW2 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SHDQ96IW2 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SHDQ96IW2 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
SHDQ96IW2 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SHDQ96IW2 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SHDQ96IW2 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SHDQ96IW2 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
SHDQ96IW2 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
SHDQ96IW2 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SHDQ96IW2 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
SHDQ96IW2 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
SHDQ96IW2 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SHDQ96IW2 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SHDQ96IW2 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SHDQ96IW2 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SHDQ96IW2 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SHDQ96IW2 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SHDQ96IW2 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SHDQ96IW2 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SHDQ96IW2 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SHDQ96IW2 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SHDQ96IW2 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SHDQ96IW2 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SHDQ96IW2 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SHDQ96IW2 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SHDQ96IW2 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SHDQ96IW2 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
SHDQ96IW2 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
SHDQ96IW2 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
SHDQ96IW2 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SHDQ96IW2 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SHDQ96IW2 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SHDQ96IW2 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SHDQ96IW2 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SHDQ96IW2 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SHDQ96IW2 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SHDQ96IW2 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SHDQ96IW2 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SHDQ96IW2 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SHDQ96IW2 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SHDQ96IW2 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SHDQ96IW2 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SHDQ96IW2 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SHDQ96IW2 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SHDQ96IW2 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SHDQ96IW2 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SHDQ96IW2 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SHDQ96IW2 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SHDQ96IW2 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SHDQ96IW2 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SHDQ96IW2 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SHDQ96IW2 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SHDQ96IW2 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SHDQ96IW2 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SHDQ96IW2 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SHDQ96IW2 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms