Protein–RNA interactions for Protein: Q96DT6

ATG4C, Cysteine protease ATG4C, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4CQ96DT6 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATG4CQ96DT6 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATG4CQ96DT6 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATG4CQ96DT6 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATG4CQ96DT6 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATG4CQ96DT6 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATG4CQ96DT6 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATG4CQ96DT6 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATG4CQ96DT6 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATG4CQ96DT6 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATG4CQ96DT6 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ATG4CQ96DT6 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATG4CQ96DT6 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATG4CQ96DT6 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATG4CQ96DT6 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATG4CQ96DT6 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATG4CQ96DT6 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATG4CQ96DT6 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATG4CQ96DT6 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATG4CQ96DT6 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATG4CQ96DT6 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATG4CQ96DT6 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATG4CQ96DT6 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATG4CQ96DT6 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATG4CQ96DT6 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATG4CQ96DT6 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATG4CQ96DT6 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATG4CQ96DT6 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATG4CQ96DT6 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATG4CQ96DT6 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATG4CQ96DT6 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATG4CQ96DT6 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATG4CQ96DT6 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATG4CQ96DT6 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATG4CQ96DT6 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ATG4CQ96DT6 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATG4CQ96DT6 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATG4CQ96DT6 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATG4CQ96DT6 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATG4CQ96DT6 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATG4CQ96DT6 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ATG4CQ96DT6 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATG4CQ96DT6 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATG4CQ96DT6 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATG4CQ96DT6 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATG4CQ96DT6 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATG4CQ96DT6 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATG4CQ96DT6 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATG4CQ96DT6 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATG4CQ96DT6 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATG4CQ96DT6 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATG4CQ96DT6 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATG4CQ96DT6 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATG4CQ96DT6 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATG4CQ96DT6 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
ATG4CQ96DT6 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATG4CQ96DT6 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATG4CQ96DT6 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATG4CQ96DT6 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATG4CQ96DT6 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATG4CQ96DT6 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATG4CQ96DT6 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATG4CQ96DT6 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATG4CQ96DT6 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ATG4CQ96DT6 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ATG4CQ96DT6 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ATG4CQ96DT6 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
ATG4CQ96DT6 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ATG4CQ96DT6 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATG4CQ96DT6 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ATG4CQ96DT6 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATG4CQ96DT6 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATG4CQ96DT6 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATG4CQ96DT6 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATG4CQ96DT6 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATG4CQ96DT6 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATG4CQ96DT6 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATG4CQ96DT6 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATG4CQ96DT6 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATG4CQ96DT6 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ATG4CQ96DT6 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATG4CQ96DT6 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATG4CQ96DT6 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATG4CQ96DT6 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATG4CQ96DT6 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ATG4CQ96DT6 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATG4CQ96DT6 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATG4CQ96DT6 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATG4CQ96DT6 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATG4CQ96DT6 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATG4CQ96DT6 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATG4CQ96DT6 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATG4CQ96DT6 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATG4CQ96DT6 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATG4CQ96DT6 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATG4CQ96DT6 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATG4CQ96DT6 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATG4CQ96DT6 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATG4CQ96DT6 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ATG4CQ96DT6 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms