Protein–RNA interactions for Protein: Q96BF3

TMIGD2, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD2Q96BF3 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMIGD2Q96BF3 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
TMIGD2Q96BF3 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
TMIGD2Q96BF3 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
TMIGD2Q96BF3 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
TMIGD2Q96BF3 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
TMIGD2Q96BF3 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
TMIGD2Q96BF3 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMIGD2Q96BF3 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMIGD2Q96BF3 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMIGD2Q96BF3 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMIGD2Q96BF3 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMIGD2Q96BF3 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMIGD2Q96BF3 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMIGD2Q96BF3 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMIGD2Q96BF3 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMIGD2Q96BF3 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMIGD2Q96BF3 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMIGD2Q96BF3 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMIGD2Q96BF3 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
TMIGD2Q96BF3 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMIGD2Q96BF3 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMIGD2Q96BF3 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMIGD2Q96BF3 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMIGD2Q96BF3 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMIGD2Q96BF3 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMIGD2Q96BF3 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMIGD2Q96BF3 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMIGD2Q96BF3 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMIGD2Q96BF3 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMIGD2Q96BF3 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMIGD2Q96BF3 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
TMIGD2Q96BF3 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMIGD2Q96BF3 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMIGD2Q96BF3 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMIGD2Q96BF3 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMIGD2Q96BF3 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMIGD2Q96BF3 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMIGD2Q96BF3 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMIGD2Q96BF3 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMIGD2Q96BF3 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMIGD2Q96BF3 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMIGD2Q96BF3 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMIGD2Q96BF3 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMIGD2Q96BF3 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMIGD2Q96BF3 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMIGD2Q96BF3 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMIGD2Q96BF3 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMIGD2Q96BF3 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMIGD2Q96BF3 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMIGD2Q96BF3 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMIGD2Q96BF3 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMIGD2Q96BF3 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMIGD2Q96BF3 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMIGD2Q96BF3 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMIGD2Q96BF3 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMIGD2Q96BF3 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TMIGD2Q96BF3 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMIGD2Q96BF3 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMIGD2Q96BF3 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMIGD2Q96BF3 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMIGD2Q96BF3 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMIGD2Q96BF3 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMIGD2Q96BF3 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMIGD2Q96BF3 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMIGD2Q96BF3 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMIGD2Q96BF3 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMIGD2Q96BF3 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMIGD2Q96BF3 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMIGD2Q96BF3 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMIGD2Q96BF3 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMIGD2Q96BF3 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMIGD2Q96BF3 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMIGD2Q96BF3 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMIGD2Q96BF3 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMIGD2Q96BF3 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMIGD2Q96BF3 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMIGD2Q96BF3 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMIGD2Q96BF3 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMIGD2Q96BF3 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMIGD2Q96BF3 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMIGD2Q96BF3 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMIGD2Q96BF3 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMIGD2Q96BF3 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMIGD2Q96BF3 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TMIGD2Q96BF3 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMIGD2Q96BF3 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMIGD2Q96BF3 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMIGD2Q96BF3 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TMIGD2Q96BF3 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMIGD2Q96BF3 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMIGD2Q96BF3 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMIGD2Q96BF3 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TMIGD2Q96BF3 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMIGD2Q96BF3 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TMIGD2Q96BF3 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMIGD2Q96BF3 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMIGD2Q96BF3 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMIGD2Q96BF3 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMIGD2Q96BF3 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms