Protein–RNA interactions for Protein: Q96AA3

RFT1, Protein RFT1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFT1Q96AA3 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RFT1Q96AA3 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RFT1Q96AA3 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RFT1Q96AA3 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RFT1Q96AA3 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RFT1Q96AA3 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RFT1Q96AA3 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RFT1Q96AA3 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RFT1Q96AA3 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RFT1Q96AA3 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RFT1Q96AA3 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RFT1Q96AA3 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RFT1Q96AA3 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RFT1Q96AA3 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RFT1Q96AA3 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RFT1Q96AA3 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RFT1Q96AA3 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RFT1Q96AA3 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RFT1Q96AA3 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RFT1Q96AA3 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RFT1Q96AA3 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RFT1Q96AA3 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RFT1Q96AA3 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RFT1Q96AA3 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RFT1Q96AA3 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RFT1Q96AA3 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RFT1Q96AA3 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RFT1Q96AA3 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RFT1Q96AA3 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RFT1Q96AA3 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RFT1Q96AA3 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RFT1Q96AA3 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RFT1Q96AA3 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RFT1Q96AA3 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RFT1Q96AA3 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RFT1Q96AA3 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RFT1Q96AA3 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RFT1Q96AA3 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RFT1Q96AA3 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RFT1Q96AA3 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RFT1Q96AA3 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RFT1Q96AA3 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RFT1Q96AA3 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RFT1Q96AA3 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RFT1Q96AA3 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RFT1Q96AA3 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RFT1Q96AA3 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RFT1Q96AA3 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RFT1Q96AA3 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RFT1Q96AA3 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RFT1Q96AA3 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RFT1Q96AA3 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RFT1Q96AA3 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RFT1Q96AA3 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RFT1Q96AA3 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
RFT1Q96AA3 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RFT1Q96AA3 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RFT1Q96AA3 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RFT1Q96AA3 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RFT1Q96AA3 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
RFT1Q96AA3 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RFT1Q96AA3 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RFT1Q96AA3 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
RFT1Q96AA3 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RFT1Q96AA3 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RFT1Q96AA3 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RFT1Q96AA3 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RFT1Q96AA3 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RFT1Q96AA3 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
RFT1Q96AA3 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RFT1Q96AA3 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RFT1Q96AA3 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
RFT1Q96AA3 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RFT1Q96AA3 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RFT1Q96AA3 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
RFT1Q96AA3 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RFT1Q96AA3 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RFT1Q96AA3 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RFT1Q96AA3 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RFT1Q96AA3 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RFT1Q96AA3 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RFT1Q96AA3 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RFT1Q96AA3 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RFT1Q96AA3 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RFT1Q96AA3 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RFT1Q96AA3 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RFT1Q96AA3 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RFT1Q96AA3 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RFT1Q96AA3 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RFT1Q96AA3 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RFT1Q96AA3 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RFT1Q96AA3 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RFT1Q96AA3 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RFT1Q96AA3 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RFT1Q96AA3 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RFT1Q96AA3 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RFT1Q96AA3 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RFT1Q96AA3 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RFT1Q96AA3 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RFT1Q96AA3 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms