Protein–RNA interactions for Protein: Q96A61

TRIM52, Tripartite motif-containing protein 52, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM52Q96A61 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TRIM52Q96A61 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TRIM52Q96A61 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
TRIM52Q96A61 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TRIM52Q96A61 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TRIM52Q96A61 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TRIM52Q96A61 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TRIM52Q96A61 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TRIM52Q96A61 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TRIM52Q96A61 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TRIM52Q96A61 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TRIM52Q96A61 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRIM52Q96A61 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRIM52Q96A61 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRIM52Q96A61 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRIM52Q96A61 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRIM52Q96A61 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRIM52Q96A61 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRIM52Q96A61 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRIM52Q96A61 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRIM52Q96A61 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRIM52Q96A61 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRIM52Q96A61 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRIM52Q96A61 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRIM52Q96A61 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRIM52Q96A61 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRIM52Q96A61 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRIM52Q96A61 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRIM52Q96A61 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRIM52Q96A61 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRIM52Q96A61 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRIM52Q96A61 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRIM52Q96A61 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
TRIM52Q96A61 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRIM52Q96A61 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRIM52Q96A61 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRIM52Q96A61 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRIM52Q96A61 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRIM52Q96A61 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRIM52Q96A61 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRIM52Q96A61 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRIM52Q96A61 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRIM52Q96A61 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
TRIM52Q96A61 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
TRIM52Q96A61 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRIM52Q96A61 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRIM52Q96A61 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRIM52Q96A61 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRIM52Q96A61 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRIM52Q96A61 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRIM52Q96A61 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRIM52Q96A61 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRIM52Q96A61 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRIM52Q96A61 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRIM52Q96A61 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRIM52Q96A61 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRIM52Q96A61 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRIM52Q96A61 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRIM52Q96A61 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TRIM52Q96A61 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TRIM52Q96A61 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TRIM52Q96A61 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TRIM52Q96A61 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TRIM52Q96A61 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TRIM52Q96A61 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TRIM52Q96A61 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TRIM52Q96A61 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TRIM52Q96A61 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TRIM52Q96A61 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TRIM52Q96A61 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
TRIM52Q96A61 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
TRIM52Q96A61 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
TRIM52Q96A61 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
TRIM52Q96A61 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.05
TRIM52Q96A61 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
TRIM52Q96A61 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TRIM52Q96A61 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TRIM52Q96A61 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TRIM52Q96A61 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
TRIM52Q96A61 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TRIM52Q96A61 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TRIM52Q96A61 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TRIM52Q96A61 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TRIM52Q96A61 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TRIM52Q96A61 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TRIM52Q96A61 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TRIM52Q96A61 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TRIM52Q96A61 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TRIM52Q96A61 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
TRIM52Q96A61 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TRIM52Q96A61 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TRIM52Q96A61 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TRIM52Q96A61 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TRIM52Q96A61 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TRIM52Q96A61 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRIM52Q96A61 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRIM52Q96A61 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRIM52Q96A61 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRIM52Q96A61 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRIM52Q96A61 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms