Protein–RNA interactions for Protein: Q96A19

CCDC102A, Coiled-coil domain-containing protein 102A, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC102AQ96A19 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC102AQ96A19 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC102AQ96A19 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC102AQ96A19 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC102AQ96A19 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC102AQ96A19 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC102AQ96A19 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC102AQ96A19 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC102AQ96A19 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC102AQ96A19 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC102AQ96A19 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC102AQ96A19 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC102AQ96A19 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC102AQ96A19 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC102AQ96A19 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC102AQ96A19 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC102AQ96A19 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC102AQ96A19 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC102AQ96A19 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC102AQ96A19 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC102AQ96A19 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC102AQ96A19 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC102AQ96A19 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC102AQ96A19 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC102AQ96A19 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC102AQ96A19 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC102AQ96A19 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC102AQ96A19 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC102AQ96A19 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC102AQ96A19 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC102AQ96A19 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC102AQ96A19 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC102AQ96A19 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC102AQ96A19 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC102AQ96A19 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC102AQ96A19 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC102AQ96A19 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC102AQ96A19 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC102AQ96A19 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC102AQ96A19 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC102AQ96A19 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC102AQ96A19 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC102AQ96A19 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC102AQ96A19 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC102AQ96A19 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC102AQ96A19 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC102AQ96A19 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC102AQ96A19 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC102AQ96A19 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC102AQ96A19 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC102AQ96A19 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC102AQ96A19 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC102AQ96A19 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC102AQ96A19 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC102AQ96A19 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC102AQ96A19 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC102AQ96A19 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC102AQ96A19 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC102AQ96A19 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC102AQ96A19 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC102AQ96A19 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC102AQ96A19 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC102AQ96A19 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC102AQ96A19 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC102AQ96A19 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC102AQ96A19 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC102AQ96A19 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC102AQ96A19 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC102AQ96A19 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC102AQ96A19 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC102AQ96A19 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC102AQ96A19 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC102AQ96A19 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC102AQ96A19 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC102AQ96A19 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC102AQ96A19 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC102AQ96A19 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC102AQ96A19 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC102AQ96A19 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC102AQ96A19 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC102AQ96A19 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC102AQ96A19 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC102AQ96A19 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC102AQ96A19 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC102AQ96A19 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC102AQ96A19 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC102AQ96A19 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC102AQ96A19 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC102AQ96A19 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC102AQ96A19 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC102AQ96A19 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC102AQ96A19 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC102AQ96A19 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC102AQ96A19 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC102AQ96A19 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC102AQ96A19 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC102AQ96A19 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC102AQ96A19 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC102AQ96A19 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC102AQ96A19 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms