Protein–RNA interactions for Protein: Q92922

SMARCC1, SWI/SNF complex subunit SMARCC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCC1Q92922 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMARCC1Q92922 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SMARCC1Q92922 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMARCC1Q92922 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMARCC1Q92922 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMARCC1Q92922 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMARCC1Q92922 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMARCC1Q92922 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMARCC1Q92922 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMARCC1Q92922 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMARCC1Q92922 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMARCC1Q92922 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMARCC1Q92922 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMARCC1Q92922 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMARCC1Q92922 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMARCC1Q92922 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMARCC1Q92922 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMARCC1Q92922 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMARCC1Q92922 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMARCC1Q92922 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMARCC1Q92922 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMARCC1Q92922 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SMARCC1Q92922 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMARCC1Q92922 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMARCC1Q92922 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMARCC1Q92922 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMARCC1Q92922 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMARCC1Q92922 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMARCC1Q92922 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMARCC1Q92922 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMARCC1Q92922 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SMARCC1Q92922 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMARCC1Q92922 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMARCC1Q92922 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMARCC1Q92922 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMARCC1Q92922 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMARCC1Q92922 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMARCC1Q92922 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMARCC1Q92922 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMARCC1Q92922 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SMARCC1Q92922 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMARCC1Q92922 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMARCC1Q92922 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMARCC1Q92922 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMARCC1Q92922 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMARCC1Q92922 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMARCC1Q92922 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMARCC1Q92922 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMARCC1Q92922 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMARCC1Q92922 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMARCC1Q92922 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SMARCC1Q92922 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SMARCC1Q92922 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMARCC1Q92922 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMARCC1Q92922 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMARCC1Q92922 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SMARCC1Q92922 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SMARCC1Q92922 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SMARCC1Q92922 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMARCC1Q92922 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMARCC1Q92922 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMARCC1Q92922 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMARCC1Q92922 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SMARCC1Q92922 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMARCC1Q92922 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMARCC1Q92922 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMARCC1Q92922 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SMARCC1Q92922 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SMARCC1Q92922 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMARCC1Q92922 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMARCC1Q92922 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMARCC1Q92922 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SMARCC1Q92922 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SMARCC1Q92922 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SMARCC1Q92922 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMARCC1Q92922 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMARCC1Q92922 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMARCC1Q92922 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMARCC1Q92922 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMARCC1Q92922 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMARCC1Q92922 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMARCC1Q92922 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMARCC1Q92922 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMARCC1Q92922 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMARCC1Q92922 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMARCC1Q92922 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMARCC1Q92922 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMARCC1Q92922 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMARCC1Q92922 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMARCC1Q92922 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMARCC1Q92922 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMARCC1Q92922 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMARCC1Q92922 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMARCC1Q92922 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMARCC1Q92922 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMARCC1Q92922 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMARCC1Q92922 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMARCC1Q92922 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMARCC1Q92922 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMARCC1Q92922 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms