Protein–RNA interactions for Protein: Q92837

FRAT1, Proto-oncogene FRAT1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRAT1Q92837 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FRAT1Q92837 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FRAT1Q92837 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FRAT1Q92837 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FRAT1Q92837 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FRAT1Q92837 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FRAT1Q92837 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FRAT1Q92837 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FRAT1Q92837 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FRAT1Q92837 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FRAT1Q92837 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FRAT1Q92837 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FRAT1Q92837 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FRAT1Q92837 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FRAT1Q92837 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FRAT1Q92837 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FRAT1Q92837 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FRAT1Q92837 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FRAT1Q92837 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
FRAT1Q92837 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
FRAT1Q92837 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FRAT1Q92837 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FRAT1Q92837 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FRAT1Q92837 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FRAT1Q92837 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FRAT1Q92837 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FRAT1Q92837 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FRAT1Q92837 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FRAT1Q92837 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FRAT1Q92837 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FRAT1Q92837 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FRAT1Q92837 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FRAT1Q92837 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FRAT1Q92837 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
FRAT1Q92837 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FRAT1Q92837 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FRAT1Q92837 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FRAT1Q92837 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FRAT1Q92837 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FRAT1Q92837 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FRAT1Q92837 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FRAT1Q92837 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FRAT1Q92837 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FRAT1Q92837 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
FRAT1Q92837 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FRAT1Q92837 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FRAT1Q92837 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FRAT1Q92837 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FRAT1Q92837 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FRAT1Q92837 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FRAT1Q92837 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FRAT1Q92837 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FRAT1Q92837 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FRAT1Q92837 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FRAT1Q92837 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FRAT1Q92837 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FRAT1Q92837 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
FRAT1Q92837 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FRAT1Q92837 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FRAT1Q92837 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FRAT1Q92837 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FRAT1Q92837 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FRAT1Q92837 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FRAT1Q92837 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FRAT1Q92837 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FRAT1Q92837 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FRAT1Q92837 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FRAT1Q92837 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FRAT1Q92837 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FRAT1Q92837 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FRAT1Q92837 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FRAT1Q92837 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FRAT1Q92837 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FRAT1Q92837 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FRAT1Q92837 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FRAT1Q92837 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
FRAT1Q92837 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FRAT1Q92837 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FRAT1Q92837 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FRAT1Q92837 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FRAT1Q92837 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FRAT1Q92837 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FRAT1Q92837 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FRAT1Q92837 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FRAT1Q92837 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FRAT1Q92837 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
FRAT1Q92837 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FRAT1Q92837 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FRAT1Q92837 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FRAT1Q92837 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FRAT1Q92837 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FRAT1Q92837 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FRAT1Q92837 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FRAT1Q92837 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FRAT1Q92837 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FRAT1Q92837 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FRAT1Q92837 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FRAT1Q92837 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FRAT1Q92837 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FRAT1Q92837 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms