Protein–RNA interactions for Protein: Q92576

PHF3, PHD finger protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF3Q92576 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PHF3Q92576 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PHF3Q92576 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PHF3Q92576 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PHF3Q92576 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PHF3Q92576 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PHF3Q92576 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PHF3Q92576 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PHF3Q92576 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PHF3Q92576 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PHF3Q92576 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PHF3Q92576 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PHF3Q92576 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PHF3Q92576 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PHF3Q92576 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PHF3Q92576 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PHF3Q92576 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PHF3Q92576 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PHF3Q92576 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PHF3Q92576 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PHF3Q92576 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PHF3Q92576 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PHF3Q92576 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PHF3Q92576 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PHF3Q92576 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PHF3Q92576 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PHF3Q92576 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PHF3Q92576 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PHF3Q92576 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PHF3Q92576 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHF3Q92576 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHF3Q92576 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHF3Q92576 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHF3Q92576 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHF3Q92576 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHF3Q92576 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHF3Q92576 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHF3Q92576 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHF3Q92576 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHF3Q92576 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHF3Q92576 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHF3Q92576 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHF3Q92576 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHF3Q92576 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHF3Q92576 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHF3Q92576 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHF3Q92576 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHF3Q92576 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHF3Q92576 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHF3Q92576 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHF3Q92576 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHF3Q92576 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHF3Q92576 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHF3Q92576 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHF3Q92576 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHF3Q92576 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHF3Q92576 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHF3Q92576 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PHF3Q92576 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHF3Q92576 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHF3Q92576 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHF3Q92576 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHF3Q92576 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHF3Q92576 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHF3Q92576 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHF3Q92576 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHF3Q92576 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PHF3Q92576 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PHF3Q92576 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PHF3Q92576 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PHF3Q92576 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PHF3Q92576 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PHF3Q92576 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PHF3Q92576 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PHF3Q92576 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PHF3Q92576 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PHF3Q92576 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PHF3Q92576 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PHF3Q92576 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PHF3Q92576 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PHF3Q92576 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PHF3Q92576 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PHF3Q92576 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PHF3Q92576 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PHF3Q92576 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PHF3Q92576 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PHF3Q92576 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PHF3Q92576 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PHF3Q92576 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PHF3Q92576 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PHF3Q92576 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PHF3Q92576 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PHF3Q92576 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PHF3Q92576 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PHF3Q92576 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PHF3Q92576 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PHF3Q92576 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PHF3Q92576 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PHF3Q92576 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PHF3Q92576 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms