Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEQ0

SNX29, Sorting nexin-29, humanhuman

Predictions only

Length 813 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29Q8TEQ0 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SNX29Q8TEQ0 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SNX29Q8TEQ0 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SNX29Q8TEQ0 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SNX29Q8TEQ0 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SNX29Q8TEQ0 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SNX29Q8TEQ0 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SNX29Q8TEQ0 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SNX29Q8TEQ0 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SNX29Q8TEQ0 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SNX29Q8TEQ0 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SNX29Q8TEQ0 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SNX29Q8TEQ0 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SNX29Q8TEQ0 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SNX29Q8TEQ0 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SNX29Q8TEQ0 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SNX29Q8TEQ0 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SNX29Q8TEQ0 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SNX29Q8TEQ0 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SNX29Q8TEQ0 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SNX29Q8TEQ0 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SNX29Q8TEQ0 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SNX29Q8TEQ0 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SNX29Q8TEQ0 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SNX29Q8TEQ0 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SNX29Q8TEQ0 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SNX29Q8TEQ0 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SNX29Q8TEQ0 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SNX29Q8TEQ0 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SNX29Q8TEQ0 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SNX29Q8TEQ0 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SNX29Q8TEQ0 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SNX29Q8TEQ0 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SNX29Q8TEQ0 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SNX29Q8TEQ0 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SNX29Q8TEQ0 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SNX29Q8TEQ0 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SNX29Q8TEQ0 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SNX29Q8TEQ0 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SNX29Q8TEQ0 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SNX29Q8TEQ0 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SNX29Q8TEQ0 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SNX29Q8TEQ0 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SNX29Q8TEQ0 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SNX29Q8TEQ0 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SNX29Q8TEQ0 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SNX29Q8TEQ0 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SNX29Q8TEQ0 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SNX29Q8TEQ0 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SNX29Q8TEQ0 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SNX29Q8TEQ0 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SNX29Q8TEQ0 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SNX29Q8TEQ0 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SNX29Q8TEQ0 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SNX29Q8TEQ0 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SNX29Q8TEQ0 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SNX29Q8TEQ0 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SNX29Q8TEQ0 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SNX29Q8TEQ0 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SNX29Q8TEQ0 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SNX29Q8TEQ0 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SNX29Q8TEQ0 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SNX29Q8TEQ0 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SNX29Q8TEQ0 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SNX29Q8TEQ0 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SNX29Q8TEQ0 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SNX29Q8TEQ0 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SNX29Q8TEQ0 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
SNX29Q8TEQ0 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SNX29Q8TEQ0 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SNX29Q8TEQ0 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SNX29Q8TEQ0 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SNX29Q8TEQ0 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SNX29Q8TEQ0 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SNX29Q8TEQ0 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNX29Q8TEQ0 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNX29Q8TEQ0 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNX29Q8TEQ0 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNX29Q8TEQ0 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNX29Q8TEQ0 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNX29Q8TEQ0 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNX29Q8TEQ0 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNX29Q8TEQ0 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNX29Q8TEQ0 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNX29Q8TEQ0 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNX29Q8TEQ0 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNX29Q8TEQ0 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNX29Q8TEQ0 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNX29Q8TEQ0 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNX29Q8TEQ0 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SNX29Q8TEQ0 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SNX29Q8TEQ0 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNX29Q8TEQ0 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNX29Q8TEQ0 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNX29Q8TEQ0 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNX29Q8TEQ0 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNX29Q8TEQ0 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNX29Q8TEQ0 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNX29Q8TEQ0 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SNX29Q8TEQ0 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms