Protein–RNA interactions for Protein: Q8NE01

CNNM3, Metal transporter CNNM3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNNM3Q8NE01 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNNM3Q8NE01 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNNM3Q8NE01 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNNM3Q8NE01 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CNNM3Q8NE01 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNNM3Q8NE01 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNNM3Q8NE01 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNNM3Q8NE01 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNNM3Q8NE01 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNNM3Q8NE01 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNNM3Q8NE01 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNNM3Q8NE01 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CNNM3Q8NE01 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNNM3Q8NE01 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNNM3Q8NE01 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNNM3Q8NE01 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNNM3Q8NE01 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNNM3Q8NE01 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNNM3Q8NE01 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNNM3Q8NE01 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNNM3Q8NE01 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNNM3Q8NE01 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNNM3Q8NE01 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNNM3Q8NE01 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNNM3Q8NE01 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNNM3Q8NE01 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNNM3Q8NE01 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNNM3Q8NE01 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNNM3Q8NE01 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CNNM3Q8NE01 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CNNM3Q8NE01 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNNM3Q8NE01 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNNM3Q8NE01 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNNM3Q8NE01 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNNM3Q8NE01 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNNM3Q8NE01 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNNM3Q8NE01 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNNM3Q8NE01 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNNM3Q8NE01 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CNNM3Q8NE01 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNNM3Q8NE01 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNNM3Q8NE01 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNNM3Q8NE01 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNNM3Q8NE01 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNNM3Q8NE01 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNNM3Q8NE01 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNNM3Q8NE01 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNNM3Q8NE01 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNNM3Q8NE01 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNNM3Q8NE01 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CNNM3Q8NE01 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNNM3Q8NE01 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNNM3Q8NE01 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNNM3Q8NE01 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNNM3Q8NE01 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNNM3Q8NE01 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNNM3Q8NE01 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNNM3Q8NE01 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNNM3Q8NE01 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNNM3Q8NE01 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNNM3Q8NE01 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNNM3Q8NE01 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNNM3Q8NE01 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNNM3Q8NE01 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNNM3Q8NE01 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNNM3Q8NE01 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNNM3Q8NE01 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNNM3Q8NE01 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNNM3Q8NE01 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNNM3Q8NE01 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNNM3Q8NE01 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNNM3Q8NE01 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNNM3Q8NE01 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNNM3Q8NE01 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNNM3Q8NE01 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNNM3Q8NE01 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CNNM3Q8NE01 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNNM3Q8NE01 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNNM3Q8NE01 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNNM3Q8NE01 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNNM3Q8NE01 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNNM3Q8NE01 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNNM3Q8NE01 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNNM3Q8NE01 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CNNM3Q8NE01 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNNM3Q8NE01 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNNM3Q8NE01 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNNM3Q8NE01 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNNM3Q8NE01 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNNM3Q8NE01 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNNM3Q8NE01 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNNM3Q8NE01 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNNM3Q8NE01 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNNM3Q8NE01 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNNM3Q8NE01 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNNM3Q8NE01 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNNM3Q8NE01 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNNM3Q8NE01 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNNM3Q8NE01 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNNM3Q8NE01 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
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