Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCQ3

LINC00301, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00301, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00301Q8NCQ3 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LINC00301Q8NCQ3 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LINC00301Q8NCQ3 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LINC00301Q8NCQ3 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LINC00301Q8NCQ3 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LINC00301Q8NCQ3 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LINC00301Q8NCQ3 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LINC00301Q8NCQ3 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LINC00301Q8NCQ3 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LINC00301Q8NCQ3 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LINC00301Q8NCQ3 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LINC00301Q8NCQ3 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LINC00301Q8NCQ3 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LINC00301Q8NCQ3 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LINC00301Q8NCQ3 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
LINC00301Q8NCQ3 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LINC00301Q8NCQ3 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LINC00301Q8NCQ3 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LINC00301Q8NCQ3 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LINC00301Q8NCQ3 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LINC00301Q8NCQ3 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LINC00301Q8NCQ3 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LINC00301Q8NCQ3 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
LINC00301Q8NCQ3 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LINC00301Q8NCQ3 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
LINC00301Q8NCQ3 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LINC00301Q8NCQ3 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
LINC00301Q8NCQ3 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LINC00301Q8NCQ3 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LINC00301Q8NCQ3 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LINC00301Q8NCQ3 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LINC00301Q8NCQ3 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LINC00301Q8NCQ3 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LINC00301Q8NCQ3 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LINC00301Q8NCQ3 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LINC00301Q8NCQ3 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LINC00301Q8NCQ3 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LINC00301Q8NCQ3 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
LINC00301Q8NCQ3 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
LINC00301Q8NCQ3 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LINC00301Q8NCQ3 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LINC00301Q8NCQ3 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LINC00301Q8NCQ3 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LINC00301Q8NCQ3 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LINC00301Q8NCQ3 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LINC00301Q8NCQ3 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LINC00301Q8NCQ3 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LINC00301Q8NCQ3 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LINC00301Q8NCQ3 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LINC00301Q8NCQ3 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LINC00301Q8NCQ3 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LINC00301Q8NCQ3 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
LINC00301Q8NCQ3 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
LINC00301Q8NCQ3 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LINC00301Q8NCQ3 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
LINC00301Q8NCQ3 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LINC00301Q8NCQ3 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LINC00301Q8NCQ3 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LINC00301Q8NCQ3 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LINC00301Q8NCQ3 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LINC00301Q8NCQ3 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LINC00301Q8NCQ3 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LINC00301Q8NCQ3 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LINC00301Q8NCQ3 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LINC00301Q8NCQ3 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LINC00301Q8NCQ3 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LINC00301Q8NCQ3 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LINC00301Q8NCQ3 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LINC00301Q8NCQ3 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LINC00301Q8NCQ3 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LINC00301Q8NCQ3 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LINC00301Q8NCQ3 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
LINC00301Q8NCQ3 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LINC00301Q8NCQ3 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LINC00301Q8NCQ3 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LINC00301Q8NCQ3 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
LINC00301Q8NCQ3 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
LINC00301Q8NCQ3 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LINC00301Q8NCQ3 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LINC00301Q8NCQ3 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LINC00301Q8NCQ3 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LINC00301Q8NCQ3 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LINC00301Q8NCQ3 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LINC00301Q8NCQ3 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LINC00301Q8NCQ3 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LINC00301Q8NCQ3 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LINC00301Q8NCQ3 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LINC00301Q8NCQ3 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LINC00301Q8NCQ3 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LINC00301Q8NCQ3 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LINC00301Q8NCQ3 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LINC00301Q8NCQ3 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LINC00301Q8NCQ3 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LINC00301Q8NCQ3 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LINC00301Q8NCQ3 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LINC00301Q8NCQ3 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LINC00301Q8NCQ3 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LINC00301Q8NCQ3 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LINC00301Q8NCQ3 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
LINC00301Q8NCQ3 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms