Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9I9

DTX3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase DTX3, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX3Q8N9I9 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DTX3Q8N9I9 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DTX3Q8N9I9 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DTX3Q8N9I9 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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DTX3Q8N9I9 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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DTX3Q8N9I9 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
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DTX3Q8N9I9 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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DTX3Q8N9I9 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
DTX3Q8N9I9 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DTX3Q8N9I9 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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DTX3Q8N9I9 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
DTX3Q8N9I9 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DTX3Q8N9I9 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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DTX3Q8N9I9 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
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DTX3Q8N9I9 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
DTX3Q8N9I9 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
DTX3Q8N9I9 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DTX3Q8N9I9 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DTX3Q8N9I9 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DTX3Q8N9I9 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
DTX3Q8N9I9 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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