Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6C5

IGSF1, Immunoglobulin superfamily member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF1Q8N6C5 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
IGSF1Q8N6C5 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
IGSF1Q8N6C5 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
IGSF1Q8N6C5 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
IGSF1Q8N6C5 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
IGSF1Q8N6C5 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
IGSF1Q8N6C5 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
IGSF1Q8N6C5 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
IGSF1Q8N6C5 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
IGSF1Q8N6C5 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
IGSF1Q8N6C5 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
IGSF1Q8N6C5 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
IGSF1Q8N6C5 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
IGSF1Q8N6C5 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
IGSF1Q8N6C5 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
IGSF1Q8N6C5 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
IGSF1Q8N6C5 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
IGSF1Q8N6C5 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
IGSF1Q8N6C5 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
IGSF1Q8N6C5 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
IGSF1Q8N6C5 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
IGSF1Q8N6C5 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
IGSF1Q8N6C5 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
IGSF1Q8N6C5 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
IGSF1Q8N6C5 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
IGSF1Q8N6C5 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
IGSF1Q8N6C5 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
IGSF1Q8N6C5 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
IGSF1Q8N6C5 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
IGSF1Q8N6C5 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
IGSF1Q8N6C5 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
IGSF1Q8N6C5 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
IGSF1Q8N6C5 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
IGSF1Q8N6C5 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
IGSF1Q8N6C5 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
IGSF1Q8N6C5 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
IGSF1Q8N6C5 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
IGSF1Q8N6C5 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
IGSF1Q8N6C5 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
IGSF1Q8N6C5 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
IGSF1Q8N6C5 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
IGSF1Q8N6C5 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
IGSF1Q8N6C5 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
IGSF1Q8N6C5 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
IGSF1Q8N6C5 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
IGSF1Q8N6C5 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
IGSF1Q8N6C5 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
IGSF1Q8N6C5 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
IGSF1Q8N6C5 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
IGSF1Q8N6C5 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
IGSF1Q8N6C5 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
IGSF1Q8N6C5 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
IGSF1Q8N6C5 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
IGSF1Q8N6C5 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
IGSF1Q8N6C5 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
IGSF1Q8N6C5 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
IGSF1Q8N6C5 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
IGSF1Q8N6C5 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
IGSF1Q8N6C5 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
IGSF1Q8N6C5 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
IGSF1Q8N6C5 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
IGSF1Q8N6C5 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
IGSF1Q8N6C5 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
IGSF1Q8N6C5 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
IGSF1Q8N6C5 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
IGSF1Q8N6C5 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
IGSF1Q8N6C5 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
IGSF1Q8N6C5 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
IGSF1Q8N6C5 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
IGSF1Q8N6C5 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
IGSF1Q8N6C5 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
IGSF1Q8N6C5 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
IGSF1Q8N6C5 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
IGSF1Q8N6C5 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
IGSF1Q8N6C5 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
IGSF1Q8N6C5 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
IGSF1Q8N6C5 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
IGSF1Q8N6C5 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
IGSF1Q8N6C5 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
IGSF1Q8N6C5 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
IGSF1Q8N6C5 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
IGSF1Q8N6C5 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
IGSF1Q8N6C5 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
IGSF1Q8N6C5 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
IGSF1Q8N6C5 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
IGSF1Q8N6C5 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
IGSF1Q8N6C5 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
IGSF1Q8N6C5 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
IGSF1Q8N6C5 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
IGSF1Q8N6C5 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
IGSF1Q8N6C5 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
IGSF1Q8N6C5 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
IGSF1Q8N6C5 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
IGSF1Q8N6C5 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
IGSF1Q8N6C5 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
IGSF1Q8N6C5 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
IGSF1Q8N6C5 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
IGSF1Q8N6C5 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
IGSF1Q8N6C5 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
IGSF1Q8N6C5 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms