Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUI4

SNX29P2, Putative protein SNX29P2, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29P2Q8IUI4 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX29P2Q8IUI4 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX29P2Q8IUI4 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX29P2Q8IUI4 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX29P2Q8IUI4 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX29P2Q8IUI4 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX29P2Q8IUI4 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX29P2Q8IUI4 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX29P2Q8IUI4 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX29P2Q8IUI4 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX29P2Q8IUI4 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX29P2Q8IUI4 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX29P2Q8IUI4 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX29P2Q8IUI4 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX29P2Q8IUI4 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX29P2Q8IUI4 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX29P2Q8IUI4 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX29P2Q8IUI4 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX29P2Q8IUI4 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX29P2Q8IUI4 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX29P2Q8IUI4 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX29P2Q8IUI4 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX29P2Q8IUI4 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX29P2Q8IUI4 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX29P2Q8IUI4 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX29P2Q8IUI4 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX29P2Q8IUI4 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX29P2Q8IUI4 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX29P2Q8IUI4 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX29P2Q8IUI4 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNX29P2Q8IUI4 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNX29P2Q8IUI4 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SNX29P2Q8IUI4 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNX29P2Q8IUI4 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNX29P2Q8IUI4 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNX29P2Q8IUI4 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNX29P2Q8IUI4 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNX29P2Q8IUI4 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNX29P2Q8IUI4 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNX29P2Q8IUI4 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNX29P2Q8IUI4 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNX29P2Q8IUI4 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNX29P2Q8IUI4 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNX29P2Q8IUI4 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNX29P2Q8IUI4 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNX29P2Q8IUI4 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNX29P2Q8IUI4 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNX29P2Q8IUI4 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNX29P2Q8IUI4 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNX29P2Q8IUI4 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SNX29P2Q8IUI4 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SNX29P2Q8IUI4 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SNX29P2Q8IUI4 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SNX29P2Q8IUI4 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SNX29P2Q8IUI4 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SNX29P2Q8IUI4 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SNX29P2Q8IUI4 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SNX29P2Q8IUI4 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SNX29P2Q8IUI4 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SNX29P2Q8IUI4 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SNX29P2Q8IUI4 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNX29P2Q8IUI4 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNX29P2Q8IUI4 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNX29P2Q8IUI4 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNX29P2Q8IUI4 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNX29P2Q8IUI4 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNX29P2Q8IUI4 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNX29P2Q8IUI4 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNX29P2Q8IUI4 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SNX29P2Q8IUI4 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNX29P2Q8IUI4 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNX29P2Q8IUI4 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNX29P2Q8IUI4 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNX29P2Q8IUI4 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNX29P2Q8IUI4 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNX29P2Q8IUI4 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNX29P2Q8IUI4 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNX29P2Q8IUI4 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNX29P2Q8IUI4 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNX29P2Q8IUI4 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNX29P2Q8IUI4 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNX29P2Q8IUI4 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNX29P2Q8IUI4 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SNX29P2Q8IUI4 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNX29P2Q8IUI4 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SNX29P2Q8IUI4 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNX29P2Q8IUI4 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNX29P2Q8IUI4 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNX29P2Q8IUI4 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNX29P2Q8IUI4 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNX29P2Q8IUI4 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNX29P2Q8IUI4 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNX29P2Q8IUI4 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNX29P2Q8IUI4 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNX29P2Q8IUI4 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNX29P2Q8IUI4 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SNX29P2Q8IUI4 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNX29P2Q8IUI4 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNX29P2Q8IUI4 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNX29P2Q8IUI4 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms