Protein–RNA interactions for Protein: Q86XW9

NME9, Thioredoxin domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME9Q86XW9 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NME9Q86XW9 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NME9Q86XW9 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NME9Q86XW9 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NME9Q86XW9 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NME9Q86XW9 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NME9Q86XW9 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
NME9Q86XW9 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
NME9Q86XW9 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
NME9Q86XW9 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
NME9Q86XW9 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
NME9Q86XW9 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
NME9Q86XW9 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
NME9Q86XW9 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
NME9Q86XW9 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
NME9Q86XW9 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NME9Q86XW9 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NME9Q86XW9 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NME9Q86XW9 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NME9Q86XW9 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NME9Q86XW9 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NME9Q86XW9 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
NME9Q86XW9 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NME9Q86XW9 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NME9Q86XW9 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NME9Q86XW9 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NME9Q86XW9 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NME9Q86XW9 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
NME9Q86XW9 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
NME9Q86XW9 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NME9Q86XW9 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NME9Q86XW9 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NME9Q86XW9 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NME9Q86XW9 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NME9Q86XW9 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NME9Q86XW9 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NME9Q86XW9 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
NME9Q86XW9 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NME9Q86XW9 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NME9Q86XW9 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NME9Q86XW9 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
NME9Q86XW9 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NME9Q86XW9 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
NME9Q86XW9 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NME9Q86XW9 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NME9Q86XW9 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NME9Q86XW9 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NME9Q86XW9 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NME9Q86XW9 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NME9Q86XW9 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NME9Q86XW9 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NME9Q86XW9 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
NME9Q86XW9 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NME9Q86XW9 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
NME9Q86XW9 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NME9Q86XW9 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NME9Q86XW9 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NME9Q86XW9 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NME9Q86XW9 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NME9Q86XW9 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NME9Q86XW9 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NME9Q86XW9 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
NME9Q86XW9 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NME9Q86XW9 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NME9Q86XW9 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NME9Q86XW9 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NME9Q86XW9 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NME9Q86XW9 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NME9Q86XW9 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NME9Q86XW9 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NME9Q86XW9 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NME9Q86XW9 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NME9Q86XW9 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NME9Q86XW9 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
NME9Q86XW9 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NME9Q86XW9 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NME9Q86XW9 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NME9Q86XW9 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
NME9Q86XW9 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NME9Q86XW9 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NME9Q86XW9 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NME9Q86XW9 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NME9Q86XW9 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NME9Q86XW9 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NME9Q86XW9 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NME9Q86XW9 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NME9Q86XW9 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NME9Q86XW9 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NME9Q86XW9 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
NME9Q86XW9 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NME9Q86XW9 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NME9Q86XW9 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NME9Q86XW9 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NME9Q86XW9 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NME9Q86XW9 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NME9Q86XW9 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NME9Q86XW9 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
NME9Q86XW9 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NME9Q86XW9 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NME9Q86XW9 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms