Protein–RNA interactions for Protein: Q86VB7

CD163, Scavenger receptor cysteine-rich type 1 protein M130, humanhuman

Predictions only

Length 1,156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD163Q86VB7 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CD163Q86VB7 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CD163Q86VB7 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD163Q86VB7 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD163Q86VB7 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CD163Q86VB7 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD163Q86VB7 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD163Q86VB7 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD163Q86VB7 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD163Q86VB7 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD163Q86VB7 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD163Q86VB7 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD163Q86VB7 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD163Q86VB7 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD163Q86VB7 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD163Q86VB7 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD163Q86VB7 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD163Q86VB7 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD163Q86VB7 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD163Q86VB7 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD163Q86VB7 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CD163Q86VB7 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD163Q86VB7 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD163Q86VB7 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD163Q86VB7 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD163Q86VB7 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD163Q86VB7 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD163Q86VB7 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD163Q86VB7 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD163Q86VB7 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD163Q86VB7 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD163Q86VB7 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CD163Q86VB7 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD163Q86VB7 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD163Q86VB7 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD163Q86VB7 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CD163Q86VB7 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD163Q86VB7 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD163Q86VB7 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD163Q86VB7 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD163Q86VB7 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD163Q86VB7 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD163Q86VB7 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD163Q86VB7 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD163Q86VB7 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD163Q86VB7 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD163Q86VB7 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD163Q86VB7 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD163Q86VB7 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD163Q86VB7 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD163Q86VB7 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD163Q86VB7 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD163Q86VB7 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD163Q86VB7 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD163Q86VB7 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD163Q86VB7 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD163Q86VB7 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD163Q86VB7 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD163Q86VB7 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD163Q86VB7 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD163Q86VB7 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD163Q86VB7 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD163Q86VB7 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD163Q86VB7 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD163Q86VB7 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD163Q86VB7 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD163Q86VB7 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CD163Q86VB7 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD163Q86VB7 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD163Q86VB7 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD163Q86VB7 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD163Q86VB7 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD163Q86VB7 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD163Q86VB7 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD163Q86VB7 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD163Q86VB7 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CD163Q86VB7 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD163Q86VB7 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD163Q86VB7 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD163Q86VB7 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD163Q86VB7 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD163Q86VB7 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD163Q86VB7 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD163Q86VB7 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD163Q86VB7 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CD163Q86VB7 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD163Q86VB7 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD163Q86VB7 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD163Q86VB7 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD163Q86VB7 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD163Q86VB7 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD163Q86VB7 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD163Q86VB7 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD163Q86VB7 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD163Q86VB7 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD163Q86VB7 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD163Q86VB7 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CD163Q86VB7 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD163Q86VB7 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD163Q86VB7 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms