Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV77

C9orf139, Uncharacterized protein C9orf139, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf139Q6ZV77 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf139Q6ZV77 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf139Q6ZV77 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf139Q6ZV77 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf139Q6ZV77 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf139Q6ZV77 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf139Q6ZV77 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf139Q6ZV77 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf139Q6ZV77 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf139Q6ZV77 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf139Q6ZV77 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf139Q6ZV77 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf139Q6ZV77 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf139Q6ZV77 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf139Q6ZV77 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf139Q6ZV77 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf139Q6ZV77 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf139Q6ZV77 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf139Q6ZV77 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf139Q6ZV77 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf139Q6ZV77 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf139Q6ZV77 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf139Q6ZV77 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf139Q6ZV77 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf139Q6ZV77 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf139Q6ZV77 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf139Q6ZV77 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf139Q6ZV77 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf139Q6ZV77 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C9orf139Q6ZV77 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C9orf139Q6ZV77 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C9orf139Q6ZV77 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C9orf139Q6ZV77 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C9orf139Q6ZV77 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C9orf139Q6ZV77 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C9orf139Q6ZV77 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C9orf139Q6ZV77 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C9orf139Q6ZV77 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C9orf139Q6ZV77 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C9orf139Q6ZV77 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C9orf139Q6ZV77 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C9orf139Q6ZV77 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C9orf139Q6ZV77 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C9orf139Q6ZV77 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C9orf139Q6ZV77 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C9orf139Q6ZV77 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C9orf139Q6ZV77 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C9orf139Q6ZV77 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C9orf139Q6ZV77 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C9orf139Q6ZV77 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C9orf139Q6ZV77 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C9orf139Q6ZV77 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C9orf139Q6ZV77 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C9orf139Q6ZV77 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C9orf139Q6ZV77 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C9orf139Q6ZV77 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C9orf139Q6ZV77 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C9orf139Q6ZV77 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C9orf139Q6ZV77 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C9orf139Q6ZV77 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C9orf139Q6ZV77 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C9orf139Q6ZV77 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
C9orf139Q6ZV77 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
C9orf139Q6ZV77 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
C9orf139Q6ZV77 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
C9orf139Q6ZV77 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
C9orf139Q6ZV77 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
C9orf139Q6ZV77 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf139Q6ZV77 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf139Q6ZV77 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf139Q6ZV77 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf139Q6ZV77 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf139Q6ZV77 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf139Q6ZV77 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf139Q6ZV77 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf139Q6ZV77 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf139Q6ZV77 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf139Q6ZV77 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf139Q6ZV77 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf139Q6ZV77 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf139Q6ZV77 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf139Q6ZV77 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf139Q6ZV77 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf139Q6ZV77 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf139Q6ZV77 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf139Q6ZV77 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf139Q6ZV77 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf139Q6ZV77 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf139Q6ZV77 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf139Q6ZV77 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf139Q6ZV77 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf139Q6ZV77 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf139Q6ZV77 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf139Q6ZV77 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf139Q6ZV77 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf139Q6ZV77 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf139Q6ZV77 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf139Q6ZV77 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf139Q6ZV77 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf139Q6ZV77 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms