Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXZ0

TMIGD1, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD1Q6UXZ0 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMIGD1Q6UXZ0 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMIGD1Q6UXZ0 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMIGD1Q6UXZ0 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMIGD1Q6UXZ0 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMIGD1Q6UXZ0 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMIGD1Q6UXZ0 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TMIGD1Q6UXZ0 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TMIGD1Q6UXZ0 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMIGD1Q6UXZ0 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMIGD1Q6UXZ0 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMIGD1Q6UXZ0 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMIGD1Q6UXZ0 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMIGD1Q6UXZ0 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMIGD1Q6UXZ0 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMIGD1Q6UXZ0 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMIGD1Q6UXZ0 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMIGD1Q6UXZ0 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMIGD1Q6UXZ0 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMIGD1Q6UXZ0 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMIGD1Q6UXZ0 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMIGD1Q6UXZ0 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMIGD1Q6UXZ0 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMIGD1Q6UXZ0 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMIGD1Q6UXZ0 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMIGD1Q6UXZ0 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMIGD1Q6UXZ0 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMIGD1Q6UXZ0 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMIGD1Q6UXZ0 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMIGD1Q6UXZ0 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMIGD1Q6UXZ0 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMIGD1Q6UXZ0 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMIGD1Q6UXZ0 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMIGD1Q6UXZ0 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMIGD1Q6UXZ0 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMIGD1Q6UXZ0 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMIGD1Q6UXZ0 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMIGD1Q6UXZ0 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMIGD1Q6UXZ0 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMIGD1Q6UXZ0 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TMIGD1Q6UXZ0 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMIGD1Q6UXZ0 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMIGD1Q6UXZ0 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMIGD1Q6UXZ0 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMIGD1Q6UXZ0 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMIGD1Q6UXZ0 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMIGD1Q6UXZ0 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMIGD1Q6UXZ0 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMIGD1Q6UXZ0 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMIGD1Q6UXZ0 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMIGD1Q6UXZ0 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMIGD1Q6UXZ0 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMIGD1Q6UXZ0 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMIGD1Q6UXZ0 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMIGD1Q6UXZ0 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMIGD1Q6UXZ0 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMIGD1Q6UXZ0 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMIGD1Q6UXZ0 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMIGD1Q6UXZ0 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMIGD1Q6UXZ0 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMIGD1Q6UXZ0 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMIGD1Q6UXZ0 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMIGD1Q6UXZ0 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMIGD1Q6UXZ0 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMIGD1Q6UXZ0 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMIGD1Q6UXZ0 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMIGD1Q6UXZ0 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMIGD1Q6UXZ0 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMIGD1Q6UXZ0 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMIGD1Q6UXZ0 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMIGD1Q6UXZ0 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMIGD1Q6UXZ0 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TMIGD1Q6UXZ0 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMIGD1Q6UXZ0 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMIGD1Q6UXZ0 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TMIGD1Q6UXZ0 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMIGD1Q6UXZ0 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMIGD1Q6UXZ0 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMIGD1Q6UXZ0 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMIGD1Q6UXZ0 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMIGD1Q6UXZ0 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMIGD1Q6UXZ0 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMIGD1Q6UXZ0 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMIGD1Q6UXZ0 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMIGD1Q6UXZ0 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMIGD1Q6UXZ0 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMIGD1Q6UXZ0 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMIGD1Q6UXZ0 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMIGD1Q6UXZ0 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMIGD1Q6UXZ0 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMIGD1Q6UXZ0 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMIGD1Q6UXZ0 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMIGD1Q6UXZ0 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMIGD1Q6UXZ0 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMIGD1Q6UXZ0 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMIGD1Q6UXZ0 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMIGD1Q6UXZ0 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMIGD1Q6UXZ0 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMIGD1Q6UXZ0 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMIGD1Q6UXZ0 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.4 ms