Protein–RNA interactions for Protein: Q6UB28

METAP1D, Methionine aminopeptidase 1D, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
METAP1DQ6UB28 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
METAP1DQ6UB28 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
METAP1DQ6UB28 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
METAP1DQ6UB28 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
METAP1DQ6UB28 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
METAP1DQ6UB28 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
METAP1DQ6UB28 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
METAP1DQ6UB28 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
METAP1DQ6UB28 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
METAP1DQ6UB28 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
METAP1DQ6UB28 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
METAP1DQ6UB28 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
METAP1DQ6UB28 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
METAP1DQ6UB28 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
METAP1DQ6UB28 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
METAP1DQ6UB28 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
METAP1DQ6UB28 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
METAP1DQ6UB28 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
METAP1DQ6UB28 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
METAP1DQ6UB28 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
METAP1DQ6UB28 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
METAP1DQ6UB28 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
METAP1DQ6UB28 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
METAP1DQ6UB28 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
METAP1DQ6UB28 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
METAP1DQ6UB28 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
METAP1DQ6UB28 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
METAP1DQ6UB28 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
METAP1DQ6UB28 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
METAP1DQ6UB28 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
METAP1DQ6UB28 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
METAP1DQ6UB28 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
METAP1DQ6UB28 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
METAP1DQ6UB28 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
METAP1DQ6UB28 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
METAP1DQ6UB28 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
METAP1DQ6UB28 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
METAP1DQ6UB28 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
METAP1DQ6UB28 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
METAP1DQ6UB28 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
METAP1DQ6UB28 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
METAP1DQ6UB28 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
METAP1DQ6UB28 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
METAP1DQ6UB28 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
METAP1DQ6UB28 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
METAP1DQ6UB28 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
METAP1DQ6UB28 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
METAP1DQ6UB28 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
METAP1DQ6UB28 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
METAP1DQ6UB28 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
METAP1DQ6UB28 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
METAP1DQ6UB28 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
METAP1DQ6UB28 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
METAP1DQ6UB28 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
METAP1DQ6UB28 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
METAP1DQ6UB28 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
METAP1DQ6UB28 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
METAP1DQ6UB28 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
METAP1DQ6UB28 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
METAP1DQ6UB28 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
METAP1DQ6UB28 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
METAP1DQ6UB28 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
METAP1DQ6UB28 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
METAP1DQ6UB28 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
METAP1DQ6UB28 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
METAP1DQ6UB28 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
METAP1DQ6UB28 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
METAP1DQ6UB28 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
METAP1DQ6UB28 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
METAP1DQ6UB28 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
METAP1DQ6UB28 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
METAP1DQ6UB28 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
METAP1DQ6UB28 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
METAP1DQ6UB28 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
METAP1DQ6UB28 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
METAP1DQ6UB28 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
METAP1DQ6UB28 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
METAP1DQ6UB28 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
METAP1DQ6UB28 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
METAP1DQ6UB28 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
METAP1DQ6UB28 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
METAP1DQ6UB28 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
METAP1DQ6UB28 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
METAP1DQ6UB28 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
METAP1DQ6UB28 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
METAP1DQ6UB28 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
METAP1DQ6UB28 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
METAP1DQ6UB28 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
METAP1DQ6UB28 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
METAP1DQ6UB28 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
METAP1DQ6UB28 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
METAP1DQ6UB28 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
METAP1DQ6UB28 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
METAP1DQ6UB28 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
METAP1DQ6UB28 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
METAP1DQ6UB28 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
METAP1DQ6UB28 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
METAP1DQ6UB28 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
METAP1DQ6UB28 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
METAP1DQ6UB28 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms