Protein–RNA interactions for Protein: Q6U841

SLC4A10, Sodium-driven chloride bicarbonate exchanger, humanhuman

Predictions only

Length 1,118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A10Q6U841 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC4A10Q6U841 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC4A10Q6U841 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC4A10Q6U841 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC4A10Q6U841 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SLC4A10Q6U841 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SLC4A10Q6U841 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SLC4A10Q6U841 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SLC4A10Q6U841 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SLC4A10Q6U841 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SLC4A10Q6U841 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SLC4A10Q6U841 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC4A10Q6U841 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC4A10Q6U841 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC4A10Q6U841 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC4A10Q6U841 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC4A10Q6U841 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC4A10Q6U841 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC4A10Q6U841 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC4A10Q6U841 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC4A10Q6U841 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC4A10Q6U841 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC4A10Q6U841 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC4A10Q6U841 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC4A10Q6U841 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC4A10Q6U841 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC4A10Q6U841 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC4A10Q6U841 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC4A10Q6U841 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC4A10Q6U841 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC4A10Q6U841 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC4A10Q6U841 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC4A10Q6U841 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC4A10Q6U841 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC4A10Q6U841 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC4A10Q6U841 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC4A10Q6U841 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC4A10Q6U841 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC4A10Q6U841 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC4A10Q6U841 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC4A10Q6U841 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC4A10Q6U841 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC4A10Q6U841 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC4A10Q6U841 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC4A10Q6U841 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC4A10Q6U841 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC4A10Q6U841 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC4A10Q6U841 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC4A10Q6U841 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC4A10Q6U841 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC4A10Q6U841 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC4A10Q6U841 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC4A10Q6U841 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC4A10Q6U841 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC4A10Q6U841 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC4A10Q6U841 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC4A10Q6U841 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC4A10Q6U841 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC4A10Q6U841 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC4A10Q6U841 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC4A10Q6U841 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC4A10Q6U841 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC4A10Q6U841 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC4A10Q6U841 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC4A10Q6U841 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC4A10Q6U841 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC4A10Q6U841 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC4A10Q6U841 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC4A10Q6U841 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC4A10Q6U841 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC4A10Q6U841 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC4A10Q6U841 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC4A10Q6U841 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC4A10Q6U841 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC4A10Q6U841 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC4A10Q6U841 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC4A10Q6U841 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC4A10Q6U841 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC4A10Q6U841 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC4A10Q6U841 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC4A10Q6U841 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC4A10Q6U841 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC4A10Q6U841 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC4A10Q6U841 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC4A10Q6U841 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC4A10Q6U841 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC4A10Q6U841 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC4A10Q6U841 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC4A10Q6U841 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC4A10Q6U841 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC4A10Q6U841 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC4A10Q6U841 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC4A10Q6U841 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC4A10Q6U841 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC4A10Q6U841 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC4A10Q6U841 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC4A10Q6U841 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC4A10Q6U841 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC4A10Q6U841 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC4A10Q6U841 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms