Protein–RNA interactions for Protein: Q6R6M4

USP17L2, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L2Q6R6M4 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
USP17L2Q6R6M4 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
USP17L2Q6R6M4 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
USP17L2Q6R6M4 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
USP17L2Q6R6M4 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
USP17L2Q6R6M4 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
USP17L2Q6R6M4 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
USP17L2Q6R6M4 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
USP17L2Q6R6M4 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
USP17L2Q6R6M4 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
USP17L2Q6R6M4 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
USP17L2Q6R6M4 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP17L2Q6R6M4 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP17L2Q6R6M4 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP17L2Q6R6M4 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP17L2Q6R6M4 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP17L2Q6R6M4 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP17L2Q6R6M4 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP17L2Q6R6M4 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP17L2Q6R6M4 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP17L2Q6R6M4 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP17L2Q6R6M4 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP17L2Q6R6M4 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
USP17L2Q6R6M4 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP17L2Q6R6M4 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP17L2Q6R6M4 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP17L2Q6R6M4 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP17L2Q6R6M4 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP17L2Q6R6M4 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP17L2Q6R6M4 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP17L2Q6R6M4 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP17L2Q6R6M4 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP17L2Q6R6M4 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP17L2Q6R6M4 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP17L2Q6R6M4 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP17L2Q6R6M4 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP17L2Q6R6M4 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP17L2Q6R6M4 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP17L2Q6R6M4 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP17L2Q6R6M4 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP17L2Q6R6M4 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP17L2Q6R6M4 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP17L2Q6R6M4 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP17L2Q6R6M4 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP17L2Q6R6M4 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
USP17L2Q6R6M4 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP17L2Q6R6M4 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP17L2Q6R6M4 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP17L2Q6R6M4 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP17L2Q6R6M4 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP17L2Q6R6M4 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP17L2Q6R6M4 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
USP17L2Q6R6M4 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP17L2Q6R6M4 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP17L2Q6R6M4 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP17L2Q6R6M4 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP17L2Q6R6M4 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP17L2Q6R6M4 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP17L2Q6R6M4 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP17L2Q6R6M4 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP17L2Q6R6M4 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP17L2Q6R6M4 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP17L2Q6R6M4 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP17L2Q6R6M4 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP17L2Q6R6M4 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP17L2Q6R6M4 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP17L2Q6R6M4 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP17L2Q6R6M4 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP17L2Q6R6M4 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP17L2Q6R6M4 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP17L2Q6R6M4 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP17L2Q6R6M4 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP17L2Q6R6M4 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
USP17L2Q6R6M4 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP17L2Q6R6M4 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP17L2Q6R6M4 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
USP17L2Q6R6M4 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP17L2Q6R6M4 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP17L2Q6R6M4 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP17L2Q6R6M4 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
USP17L2Q6R6M4 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
USP17L2Q6R6M4 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
USP17L2Q6R6M4 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
USP17L2Q6R6M4 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP17L2Q6R6M4 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP17L2Q6R6M4 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP17L2Q6R6M4 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP17L2Q6R6M4 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP17L2Q6R6M4 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP17L2Q6R6M4 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP17L2Q6R6M4 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP17L2Q6R6M4 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP17L2Q6R6M4 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP17L2Q6R6M4 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP17L2Q6R6M4 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP17L2Q6R6M4 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP17L2Q6R6M4 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP17L2Q6R6M4 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP17L2Q6R6M4 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP17L2Q6R6M4 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms