Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5Q4

LMOD2, Leiomodin-2, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD2Q6P5Q4 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
LMOD2Q6P5Q4 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
LMOD2Q6P5Q4 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LMOD2Q6P5Q4 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LMOD2Q6P5Q4 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LMOD2Q6P5Q4 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LMOD2Q6P5Q4 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LMOD2Q6P5Q4 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LMOD2Q6P5Q4 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LMOD2Q6P5Q4 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LMOD2Q6P5Q4 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LMOD2Q6P5Q4 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LMOD2Q6P5Q4 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LMOD2Q6P5Q4 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LMOD2Q6P5Q4 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
LMOD2Q6P5Q4 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LMOD2Q6P5Q4 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LMOD2Q6P5Q4 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LMOD2Q6P5Q4 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LMOD2Q6P5Q4 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LMOD2Q6P5Q4 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LMOD2Q6P5Q4 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LMOD2Q6P5Q4 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LMOD2Q6P5Q4 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LMOD2Q6P5Q4 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LMOD2Q6P5Q4 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LMOD2Q6P5Q4 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LMOD2Q6P5Q4 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
LMOD2Q6P5Q4 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LMOD2Q6P5Q4 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LMOD2Q6P5Q4 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LMOD2Q6P5Q4 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LMOD2Q6P5Q4 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LMOD2Q6P5Q4 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LMOD2Q6P5Q4 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LMOD2Q6P5Q4 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LMOD2Q6P5Q4 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LMOD2Q6P5Q4 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LMOD2Q6P5Q4 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LMOD2Q6P5Q4 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LMOD2Q6P5Q4 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LMOD2Q6P5Q4 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LMOD2Q6P5Q4 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LMOD2Q6P5Q4 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LMOD2Q6P5Q4 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
LMOD2Q6P5Q4 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LMOD2Q6P5Q4 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
LMOD2Q6P5Q4 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LMOD2Q6P5Q4 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LMOD2Q6P5Q4 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LMOD2Q6P5Q4 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LMOD2Q6P5Q4 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LMOD2Q6P5Q4 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LMOD2Q6P5Q4 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LMOD2Q6P5Q4 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LMOD2Q6P5Q4 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LMOD2Q6P5Q4 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LMOD2Q6P5Q4 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LMOD2Q6P5Q4 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
LMOD2Q6P5Q4 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LMOD2Q6P5Q4 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LMOD2Q6P5Q4 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LMOD2Q6P5Q4 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LMOD2Q6P5Q4 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LMOD2Q6P5Q4 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LMOD2Q6P5Q4 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LMOD2Q6P5Q4 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LMOD2Q6P5Q4 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
LMOD2Q6P5Q4 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LMOD2Q6P5Q4 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LMOD2Q6P5Q4 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LMOD2Q6P5Q4 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LMOD2Q6P5Q4 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LMOD2Q6P5Q4 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LMOD2Q6P5Q4 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
LMOD2Q6P5Q4 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LMOD2Q6P5Q4 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LMOD2Q6P5Q4 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LMOD2Q6P5Q4 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LMOD2Q6P5Q4 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LMOD2Q6P5Q4 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LMOD2Q6P5Q4 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LMOD2Q6P5Q4 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LMOD2Q6P5Q4 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LMOD2Q6P5Q4 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LMOD2Q6P5Q4 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LMOD2Q6P5Q4 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LMOD2Q6P5Q4 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LMOD2Q6P5Q4 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LMOD2Q6P5Q4 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LMOD2Q6P5Q4 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LMOD2Q6P5Q4 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LMOD2Q6P5Q4 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LMOD2Q6P5Q4 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LMOD2Q6P5Q4 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LMOD2Q6P5Q4 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LMOD2Q6P5Q4 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LMOD2Q6P5Q4 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LMOD2Q6P5Q4 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LMOD2Q6P5Q4 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms