Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT4

SLC30A6, Zinc transporter 6, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC30A6Q6NXT4 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SLC30A6Q6NXT4 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC30A6Q6NXT4 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC30A6Q6NXT4 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC30A6Q6NXT4 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC30A6Q6NXT4 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC30A6Q6NXT4 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC30A6Q6NXT4 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC30A6Q6NXT4 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC30A6Q6NXT4 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC30A6Q6NXT4 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC30A6Q6NXT4 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC30A6Q6NXT4 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC30A6Q6NXT4 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC30A6Q6NXT4 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC30A6Q6NXT4 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC30A6Q6NXT4 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC30A6Q6NXT4 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC30A6Q6NXT4 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC30A6Q6NXT4 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC30A6Q6NXT4 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC30A6Q6NXT4 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC30A6Q6NXT4 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC30A6Q6NXT4 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC30A6Q6NXT4 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC30A6Q6NXT4 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC30A6Q6NXT4 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC30A6Q6NXT4 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC30A6Q6NXT4 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC30A6Q6NXT4 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC30A6Q6NXT4 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC30A6Q6NXT4 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC30A6Q6NXT4 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC30A6Q6NXT4 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC30A6Q6NXT4 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC30A6Q6NXT4 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC30A6Q6NXT4 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC30A6Q6NXT4 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC30A6Q6NXT4 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC30A6Q6NXT4 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC30A6Q6NXT4 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC30A6Q6NXT4 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC30A6Q6NXT4 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC30A6Q6NXT4 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC30A6Q6NXT4 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC30A6Q6NXT4 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC30A6Q6NXT4 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC30A6Q6NXT4 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC30A6Q6NXT4 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC30A6Q6NXT4 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC30A6Q6NXT4 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC30A6Q6NXT4 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC30A6Q6NXT4 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC30A6Q6NXT4 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC30A6Q6NXT4 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC30A6Q6NXT4 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC30A6Q6NXT4 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC30A6Q6NXT4 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC30A6Q6NXT4 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC30A6Q6NXT4 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC30A6Q6NXT4 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC30A6Q6NXT4 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC30A6Q6NXT4 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC30A6Q6NXT4 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC30A6Q6NXT4 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC30A6Q6NXT4 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC30A6Q6NXT4 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC30A6Q6NXT4 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC30A6Q6NXT4 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC30A6Q6NXT4 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC30A6Q6NXT4 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC30A6Q6NXT4 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC30A6Q6NXT4 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC30A6Q6NXT4 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC30A6Q6NXT4 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC30A6Q6NXT4 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC30A6Q6NXT4 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC30A6Q6NXT4 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC30A6Q6NXT4 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC30A6Q6NXT4 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC30A6Q6NXT4 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC30A6Q6NXT4 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC30A6Q6NXT4 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC30A6Q6NXT4 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC30A6Q6NXT4 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC30A6Q6NXT4 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC30A6Q6NXT4 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC30A6Q6NXT4 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC30A6Q6NXT4 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC30A6Q6NXT4 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC30A6Q6NXT4 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC30A6Q6NXT4 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC30A6Q6NXT4 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC30A6Q6NXT4 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC30A6Q6NXT4 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC30A6Q6NXT4 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC30A6Q6NXT4 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC30A6Q6NXT4 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC30A6Q6NXT4 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC30A6Q6NXT4 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.9 ms