Protein–RNA interactions for Protein: Q6NTF9

RHBDD2, Rhomboid domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDD2Q6NTF9 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
RHBDD2Q6NTF9 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
RHBDD2Q6NTF9 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RHBDD2Q6NTF9 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RHBDD2Q6NTF9 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RHBDD2Q6NTF9 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RHBDD2Q6NTF9 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RHBDD2Q6NTF9 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RHBDD2Q6NTF9 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RHBDD2Q6NTF9 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
RHBDD2Q6NTF9 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RHBDD2Q6NTF9 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
RHBDD2Q6NTF9 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
RHBDD2Q6NTF9 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RHBDD2Q6NTF9 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RHBDD2Q6NTF9 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RHBDD2Q6NTF9 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RHBDD2Q6NTF9 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RHBDD2Q6NTF9 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RHBDD2Q6NTF9 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RHBDD2Q6NTF9 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RHBDD2Q6NTF9 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RHBDD2Q6NTF9 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
RHBDD2Q6NTF9 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RHBDD2Q6NTF9 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RHBDD2Q6NTF9 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RHBDD2Q6NTF9 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RHBDD2Q6NTF9 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RHBDD2Q6NTF9 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RHBDD2Q6NTF9 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RHBDD2Q6NTF9 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
RHBDD2Q6NTF9 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RHBDD2Q6NTF9 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RHBDD2Q6NTF9 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
RHBDD2Q6NTF9 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RHBDD2Q6NTF9 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RHBDD2Q6NTF9 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RHBDD2Q6NTF9 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RHBDD2Q6NTF9 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
RHBDD2Q6NTF9 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RHBDD2Q6NTF9 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RHBDD2Q6NTF9 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RHBDD2Q6NTF9 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RHBDD2Q6NTF9 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
RHBDD2Q6NTF9 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RHBDD2Q6NTF9 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RHBDD2Q6NTF9 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RHBDD2Q6NTF9 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RHBDD2Q6NTF9 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RHBDD2Q6NTF9 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RHBDD2Q6NTF9 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RHBDD2Q6NTF9 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RHBDD2Q6NTF9 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RHBDD2Q6NTF9 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RHBDD2Q6NTF9 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RHBDD2Q6NTF9 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RHBDD2Q6NTF9 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RHBDD2Q6NTF9 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RHBDD2Q6NTF9 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RHBDD2Q6NTF9 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RHBDD2Q6NTF9 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RHBDD2Q6NTF9 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RHBDD2Q6NTF9 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RHBDD2Q6NTF9 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RHBDD2Q6NTF9 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RHBDD2Q6NTF9 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RHBDD2Q6NTF9 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RHBDD2Q6NTF9 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RHBDD2Q6NTF9 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RHBDD2Q6NTF9 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RHBDD2Q6NTF9 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RHBDD2Q6NTF9 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RHBDD2Q6NTF9 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
RHBDD2Q6NTF9 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RHBDD2Q6NTF9 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RHBDD2Q6NTF9 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RHBDD2Q6NTF9 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RHBDD2Q6NTF9 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
RHBDD2Q6NTF9 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RHBDD2Q6NTF9 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RHBDD2Q6NTF9 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RHBDD2Q6NTF9 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RHBDD2Q6NTF9 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RHBDD2Q6NTF9 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
RHBDD2Q6NTF9 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RHBDD2Q6NTF9 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RHBDD2Q6NTF9 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RHBDD2Q6NTF9 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RHBDD2Q6NTF9 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RHBDD2Q6NTF9 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RHBDD2Q6NTF9 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RHBDD2Q6NTF9 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RHBDD2Q6NTF9 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RHBDD2Q6NTF9 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RHBDD2Q6NTF9 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RHBDD2Q6NTF9 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RHBDD2Q6NTF9 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RHBDD2Q6NTF9 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RHBDD2Q6NTF9 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RHBDD2Q6NTF9 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms