Protein–RNA interactions for Protein: Q6JBY9

RCSD1, CapZ-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCSD1Q6JBY9 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RCSD1Q6JBY9 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RCSD1Q6JBY9 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RCSD1Q6JBY9 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RCSD1Q6JBY9 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RCSD1Q6JBY9 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RCSD1Q6JBY9 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RCSD1Q6JBY9 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RCSD1Q6JBY9 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RCSD1Q6JBY9 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RCSD1Q6JBY9 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RCSD1Q6JBY9 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RCSD1Q6JBY9 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RCSD1Q6JBY9 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RCSD1Q6JBY9 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RCSD1Q6JBY9 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RCSD1Q6JBY9 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RCSD1Q6JBY9 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RCSD1Q6JBY9 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RCSD1Q6JBY9 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RCSD1Q6JBY9 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RCSD1Q6JBY9 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RCSD1Q6JBY9 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RCSD1Q6JBY9 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RCSD1Q6JBY9 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RCSD1Q6JBY9 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RCSD1Q6JBY9 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RCSD1Q6JBY9 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RCSD1Q6JBY9 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RCSD1Q6JBY9 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RCSD1Q6JBY9 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RCSD1Q6JBY9 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RCSD1Q6JBY9 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RCSD1Q6JBY9 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RCSD1Q6JBY9 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RCSD1Q6JBY9 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RCSD1Q6JBY9 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RCSD1Q6JBY9 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RCSD1Q6JBY9 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RCSD1Q6JBY9 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RCSD1Q6JBY9 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RCSD1Q6JBY9 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RCSD1Q6JBY9 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RCSD1Q6JBY9 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RCSD1Q6JBY9 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RCSD1Q6JBY9 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RCSD1Q6JBY9 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RCSD1Q6JBY9 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RCSD1Q6JBY9 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RCSD1Q6JBY9 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RCSD1Q6JBY9 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RCSD1Q6JBY9 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RCSD1Q6JBY9 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RCSD1Q6JBY9 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RCSD1Q6JBY9 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RCSD1Q6JBY9 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RCSD1Q6JBY9 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RCSD1Q6JBY9 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RCSD1Q6JBY9 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RCSD1Q6JBY9 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RCSD1Q6JBY9 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RCSD1Q6JBY9 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RCSD1Q6JBY9 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RCSD1Q6JBY9 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RCSD1Q6JBY9 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RCSD1Q6JBY9 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RCSD1Q6JBY9 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RCSD1Q6JBY9 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RCSD1Q6JBY9 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RCSD1Q6JBY9 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RCSD1Q6JBY9 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RCSD1Q6JBY9 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RCSD1Q6JBY9 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RCSD1Q6JBY9 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RCSD1Q6JBY9 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RCSD1Q6JBY9 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RCSD1Q6JBY9 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RCSD1Q6JBY9 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RCSD1Q6JBY9 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RCSD1Q6JBY9 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RCSD1Q6JBY9 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RCSD1Q6JBY9 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RCSD1Q6JBY9 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RCSD1Q6JBY9 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RCSD1Q6JBY9 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RCSD1Q6JBY9 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RCSD1Q6JBY9 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RCSD1Q6JBY9 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RCSD1Q6JBY9 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RCSD1Q6JBY9 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RCSD1Q6JBY9 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
RCSD1Q6JBY9 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RCSD1Q6JBY9 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RCSD1Q6JBY9 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
RCSD1Q6JBY9 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RCSD1Q6JBY9 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RCSD1Q6JBY9 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RCSD1Q6JBY9 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RCSD1Q6JBY9 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RCSD1Q6JBY9 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms